Protein–RNA interactions for Protein: O89098

Cst7, Cystatin-F, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst7O89098 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cst7O89098 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cst7O89098 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cst7O89098 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cst7O89098 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cst7O89098 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cst7O89098 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cst7O89098 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cst7O89098 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cst7O89098 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cst7O89098 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cst7O89098 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cst7O89098 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cst7O89098 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cst7O89098 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cst7O89098 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cst7O89098 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cst7O89098 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cst7O89098 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cst7O89098 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cst7O89098 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cst7O89098 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cst7O89098 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cst7O89098 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cst7O89098 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cst7O89098 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cst7O89098 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cst7O89098 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cst7O89098 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cst7O89098 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cst7O89098 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cst7O89098 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cst7O89098 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cst7O89098 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cst7O89098 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cst7O89098 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cst7O89098 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cst7O89098 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cst7O89098 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cst7O89098 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cst7O89098 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cst7O89098 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cst7O89098 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cst7O89098 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cst7O89098 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cst7O89098 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cst7O89098 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cst7O89098 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cst7O89098 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cst7O89098 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cst7O89098 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cst7O89098 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cst7O89098 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cst7O89098 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cst7O89098 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cst7O89098 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cst7O89098 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cst7O89098 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cst7O89098 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cst7O89098 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cst7O89098 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cst7O89098 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cst7O89098 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cst7O89098 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cst7O89098 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cst7O89098 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cst7O89098 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cst7O89098 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cst7O89098 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cst7O89098 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cst7O89098 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cst7O89098 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cst7O89098 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cst7O89098 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cst7O89098 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cst7O89098 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cst7O89098 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cst7O89098 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cst7O89098 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cst7O89098 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cst7O89098 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cst7O89098 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cst7O89098 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cst7O89098 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cst7O89098 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cst7O89098 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cst7O89098 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cst7O89098 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cst7O89098 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cst7O89098 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cst7O89098 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cst7O89098 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cst7O89098 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cst7O89098 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cst7O89098 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cst7O89098 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cst7O89098 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cst7O89098 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cst7O89098 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cst7O89098 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms