Protein–RNA interactions for Protein: Q9D416

Arl13a, ADP-ribosylation factor-like protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13aQ9D416 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Arl13aQ9D416 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Arl13aQ9D416 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Arl13aQ9D416 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Arl13aQ9D416 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Arl13aQ9D416 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Arl13aQ9D416 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Arl13aQ9D416 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Arl13aQ9D416 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Arl13aQ9D416 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Arl13aQ9D416 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Arl13aQ9D416 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Arl13aQ9D416 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Arl13aQ9D416 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Arl13aQ9D416 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Arl13aQ9D416 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Arl13aQ9D416 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Arl13aQ9D416 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Arl13aQ9D416 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Arl13aQ9D416 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Arl13aQ9D416 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Arl13aQ9D416 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Arl13aQ9D416 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arl13aQ9D416 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Arl13aQ9D416 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Arl13aQ9D416 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arl13aQ9D416 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Arl13aQ9D416 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Arl13aQ9D416 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Arl13aQ9D416 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Arl13aQ9D416 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arl13aQ9D416 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Arl13aQ9D416 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arl13aQ9D416 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Arl13aQ9D416 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arl13aQ9D416 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arl13aQ9D416 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arl13aQ9D416 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Arl13aQ9D416 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arl13aQ9D416 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Arl13aQ9D416 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arl13aQ9D416 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arl13aQ9D416 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arl13aQ9D416 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arl13aQ9D416 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arl13aQ9D416 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Arl13aQ9D416 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Arl13aQ9D416 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arl13aQ9D416 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Arl13aQ9D416 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arl13aQ9D416 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arl13aQ9D416 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Arl13aQ9D416 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Arl13aQ9D416 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Arl13aQ9D416 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arl13aQ9D416 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arl13aQ9D416 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arl13aQ9D416 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arl13aQ9D416 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arl13aQ9D416 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Arl13aQ9D416 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Arl13aQ9D416 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arl13aQ9D416 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arl13aQ9D416 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arl13aQ9D416 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arl13aQ9D416 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Arl13aQ9D416 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arl13aQ9D416 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arl13aQ9D416 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Arl13aQ9D416 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arl13aQ9D416 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Arl13aQ9D416 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Arl13aQ9D416 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Arl13aQ9D416 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Arl13aQ9D416 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Arl13aQ9D416 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arl13aQ9D416 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arl13aQ9D416 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arl13aQ9D416 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arl13aQ9D416 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Arl13aQ9D416 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arl13aQ9D416 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Arl13aQ9D416 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Arl13aQ9D416 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Arl13aQ9D416 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Arl13aQ9D416 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Arl13aQ9D416 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Arl13aQ9D416 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arl13aQ9D416 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arl13aQ9D416 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Arl13aQ9D416 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Arl13aQ9D416 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Arl13aQ9D416 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arl13aQ9D416 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arl13aQ9D416 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arl13aQ9D416 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arl13aQ9D416 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Arl13aQ9D416 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arl13aQ9D416 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arl13aQ9D416 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms