Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDM5

Olfactory receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDM5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A286YDM5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A286YDM5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A286YDM5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A286YDM5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A286YDM5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A286YDM5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A286YDM5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A286YDM5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A286YDM5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A286YDM5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A286YDM5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A286YDM5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A286YDM5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A286YDM5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A286YDM5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A286YDM5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A286YDM5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A286YDM5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A286YDM5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A286YDM5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A286YDM5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A286YDM5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A286YDM5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A286YDM5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A286YDM5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A286YDM5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A286YDM5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A286YDM5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YDM5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YDM5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A286YDM5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YDM5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A286YDM5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A286YDM5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A286YDM5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A286YDM5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A286YDM5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A286YDM5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A286YDM5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A286YDM5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A286YDM5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A286YDM5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A286YDM5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A286YDM5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A286YDM5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A286YDM5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A286YDM5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A286YDM5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A286YDM5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A286YDM5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A286YDM5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A286YDM5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A286YDM5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A286YDM5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A286YDM5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A286YDM5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A286YDM5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A286YDM5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A286YDM5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A286YDM5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A286YDM5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A286YDM5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A286YDM5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A286YDM5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A286YDM5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A286YDM5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YDM5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A286YDM5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A286YDM5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A286YDM5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A286YDM5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A286YDM5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A286YDM5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A286YDM5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A286YDM5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A286YDM5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A286YDM5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A286YDM5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A286YDM5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A286YDM5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A286YDM5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A286YDM5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A286YDM5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YDM5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A286YDM5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YDM5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A286YDM5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A286YDM5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YDM5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YDM5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A286YDM5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YDM5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A286YDM5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A286YDM5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A286YDM5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A286YDM5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A286YDM5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A286YDM5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A286YDM5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms