Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMC9

Zfp85, Regulator of sex-limitation candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp85Q7TMC9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Zfp85Q7TMC9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp85Q7TMC9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp85Q7TMC9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp85Q7TMC9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zfp85Q7TMC9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp85Q7TMC9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp85Q7TMC9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfp85Q7TMC9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp85Q7TMC9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp85Q7TMC9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp85Q7TMC9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp85Q7TMC9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfp85Q7TMC9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp85Q7TMC9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp85Q7TMC9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp85Q7TMC9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp85Q7TMC9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp85Q7TMC9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp85Q7TMC9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp85Q7TMC9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp85Q7TMC9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp85Q7TMC9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zfp85Q7TMC9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp85Q7TMC9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp85Q7TMC9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp85Q7TMC9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp85Q7TMC9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp85Q7TMC9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp85Q7TMC9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp85Q7TMC9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp85Q7TMC9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zfp85Q7TMC9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfp85Q7TMC9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfp85Q7TMC9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp85Q7TMC9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp85Q7TMC9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp85Q7TMC9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp85Q7TMC9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp85Q7TMC9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp85Q7TMC9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp85Q7TMC9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp85Q7TMC9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp85Q7TMC9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp85Q7TMC9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp85Q7TMC9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp85Q7TMC9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp85Q7TMC9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp85Q7TMC9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp85Q7TMC9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp85Q7TMC9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp85Q7TMC9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp85Q7TMC9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp85Q7TMC9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp85Q7TMC9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp85Q7TMC9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp85Q7TMC9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp85Q7TMC9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp85Q7TMC9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp85Q7TMC9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp85Q7TMC9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp85Q7TMC9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp85Q7TMC9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp85Q7TMC9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp85Q7TMC9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp85Q7TMC9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp85Q7TMC9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp85Q7TMC9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp85Q7TMC9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp85Q7TMC9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp85Q7TMC9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp85Q7TMC9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp85Q7TMC9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp85Q7TMC9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp85Q7TMC9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp85Q7TMC9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp85Q7TMC9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp85Q7TMC9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp85Q7TMC9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp85Q7TMC9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp85Q7TMC9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp85Q7TMC9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp85Q7TMC9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp85Q7TMC9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp85Q7TMC9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp85Q7TMC9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp85Q7TMC9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp85Q7TMC9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp85Q7TMC9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp85Q7TMC9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp85Q7TMC9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp85Q7TMC9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp85Q7TMC9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp85Q7TMC9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp85Q7TMC9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp85Q7TMC9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp85Q7TMC9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp85Q7TMC9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp85Q7TMC9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp85Q7TMC9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms