Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Vmn1r194J3JS27 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Vmn1r194J3JS27 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vmn1r194J3JS27 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vmn1r194J3JS27 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vmn1r194J3JS27 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn1r194J3JS27 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r194J3JS27 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r194J3JS27 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r194J3JS27 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r194J3JS27 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn1r194J3JS27 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r194J3JS27 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r194J3JS27 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r194J3JS27 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r194J3JS27 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r194J3JS27 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r194J3JS27 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r194J3JS27 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r194J3JS27 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r194J3JS27 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r194J3JS27 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r194J3JS27 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r194J3JS27 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r194J3JS27 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r194J3JS27 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r194J3JS27 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r194J3JS27 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r194J3JS27 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r194J3JS27 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r194J3JS27 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r194J3JS27 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r194J3JS27 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r194J3JS27 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r194J3JS27 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r194J3JS27 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r194J3JS27 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r194J3JS27 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r194J3JS27 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r194J3JS27 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r194J3JS27 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r194J3JS27 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r194J3JS27 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r194J3JS27 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r194J3JS27 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r194J3JS27 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r194J3JS27 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r194J3JS27 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r194J3JS27 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r194J3JS27 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r194J3JS27 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r194J3JS27 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r194J3JS27 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r194J3JS27 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r194J3JS27 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r194J3JS27 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r194J3JS27 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r194J3JS27 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r194J3JS27 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r194J3JS27 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r194J3JS27 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r194J3JS27 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r194J3JS27 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r194J3JS27 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r194J3JS27 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r194J3JS27 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r194J3JS27 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r194J3JS27 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r194J3JS27 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r194J3JS27 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r194J3JS27 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r194J3JS27 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r194J3JS27 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r194J3JS27 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r194J3JS27 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r194J3JS27 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r194J3JS27 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r194J3JS27 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r194J3JS27 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r194J3JS27 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r194J3JS27 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r194J3JS27 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r194J3JS27 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r194J3JS27 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r194J3JS27 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r194J3JS27 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r194J3JS27 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r194J3JS27 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r194J3JS27 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r194J3JS27 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r194J3JS27 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r194J3JS27 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r194J3JS27 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r194J3JS27 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r194J3JS27 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r194J3JS27 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r194J3JS27 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r194J3JS27 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms