Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ06

Hsd17b11, Estradiol 17-beta-dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsd17b11Q9EQ06 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Hsd17b11Q9EQ06 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hsd17b11Q9EQ06 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hsd17b11Q9EQ06 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hsd17b11Q9EQ06 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hsd17b11Q9EQ06 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hsd17b11Q9EQ06 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hsd17b11Q9EQ06 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hsd17b11Q9EQ06 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hsd17b11Q9EQ06 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hsd17b11Q9EQ06 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hsd17b11Q9EQ06 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hsd17b11Q9EQ06 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hsd17b11Q9EQ06 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hsd17b11Q9EQ06 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hsd17b11Q9EQ06 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hsd17b11Q9EQ06 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hsd17b11Q9EQ06 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hsd17b11Q9EQ06 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hsd17b11Q9EQ06 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hsd17b11Q9EQ06 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hsd17b11Q9EQ06 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hsd17b11Q9EQ06 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hsd17b11Q9EQ06 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hsd17b11Q9EQ06 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hsd17b11Q9EQ06 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hsd17b11Q9EQ06 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hsd17b11Q9EQ06 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hsd17b11Q9EQ06 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hsd17b11Q9EQ06 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hsd17b11Q9EQ06 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hsd17b11Q9EQ06 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hsd17b11Q9EQ06 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hsd17b11Q9EQ06 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hsd17b11Q9EQ06 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hsd17b11Q9EQ06 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hsd17b11Q9EQ06 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hsd17b11Q9EQ06 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hsd17b11Q9EQ06 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hsd17b11Q9EQ06 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hsd17b11Q9EQ06 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hsd17b11Q9EQ06 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hsd17b11Q9EQ06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hsd17b11Q9EQ06 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hsd17b11Q9EQ06 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hsd17b11Q9EQ06 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hsd17b11Q9EQ06 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hsd17b11Q9EQ06 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hsd17b11Q9EQ06 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hsd17b11Q9EQ06 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hsd17b11Q9EQ06 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hsd17b11Q9EQ06 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hsd17b11Q9EQ06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hsd17b11Q9EQ06 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hsd17b11Q9EQ06 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hsd17b11Q9EQ06 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hsd17b11Q9EQ06 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hsd17b11Q9EQ06 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hsd17b11Q9EQ06 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hsd17b11Q9EQ06 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hsd17b11Q9EQ06 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hsd17b11Q9EQ06 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hsd17b11Q9EQ06 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hsd17b11Q9EQ06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hsd17b11Q9EQ06 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hsd17b11Q9EQ06 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsd17b11Q9EQ06 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hsd17b11Q9EQ06 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hsd17b11Q9EQ06 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hsd17b11Q9EQ06 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hsd17b11Q9EQ06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hsd17b11Q9EQ06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hsd17b11Q9EQ06 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hsd17b11Q9EQ06 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hsd17b11Q9EQ06 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hsd17b11Q9EQ06 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hsd17b11Q9EQ06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hsd17b11Q9EQ06 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms