RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GYPEP15421 78 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM16LQ309B1 348 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0G2JRQ6 117 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRIP30626 198 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYBA4P53673 196 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf83Q53S99 150 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C22orf42Q6IC83 251 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC190Q86UF4 302 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRO0255Q9UI72 69 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7EQD1 137 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCAND1P57086 179 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPCS3P61009 180 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN5P62079 268 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZRU5 148 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGLLQ99685 303 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A14Q9HCY8 104 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOTOA8MTQ0 251 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-30P01768 117 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-33P01772 117 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PI3P19957 117 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DMAP28067 261 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SP6Q3SY56 376 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAALCQ8WXS3 180 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53RKQ96S44 253 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIABLOQ9NR28 239 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCN3BQ9NY72 215 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGAM2P15259 253 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORM2P19652 201 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFSF8P32971 234 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HRH1P35367 487 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHL2Q14192 279 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THAP8Q8NA92 274 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABARAPH6UMI1 98 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATG12O94817 140 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABARAPO95166 117 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCL3P19876 107 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS2R46P59540 309 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASAH1Q13510 395 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BLNKQ8WV28 456 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TM2D2Q9BX73 214 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FABP1P07148 127 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLAQ13239 276 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM219AQ8IW50 185 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35E1Q96K37 410 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS10O43665 173 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPINK4O60575 86 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP5HO75947 161 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SFTA3P0C7M3 94 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPT1P50897 306 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGPP57054 158 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MXD1Q05195 221 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMSQ5H8A3 153 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MORN5Q5VZ52 161 aa6.62□□□□□ -1.35
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