RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A3O00476 420 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 VENTXO95231 258 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IL3RAP26951 378 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PSG9Q00887 426 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 LINC00311Q8N616 119 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SGMS2Q8NHU3 365 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 BORCS7Q96B45 105 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 FBXL15Q9H469 300 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 G3V4G9 280 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PYYP10082 97 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 HERV-K104P63124 156 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PLGLAQ15195 96 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RPEQ96AT9 228 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF503Q96F45 646 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF479Q96JC4 524 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ORM2P19652 201 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ADMP35318 185 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RHOGP84095 191 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TMEM249Q2WGJ8 235 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CCL19Q99731 98 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FCN1O00602 326 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 COX7A2P2O60397 106 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SPINK4O60575 86 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 NDUFS7O75251 213 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LY6G6DO95868 133 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 KLRD1Q13241 179 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ACACBO00763 2458 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 GGTLC3B5MD39 225 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 K7EN84 100 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ZNF253O75346 499 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IGLV1-47P01700 117 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C8orf88P0DMB2 117 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 LINC00479Q96M42 142 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 OR8B2Q96RD0 313 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ZNF747Q9BV97 191 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FBN2P35556 2912 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 HELTA6NFD8 242 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 H3BTX0 84 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MFAP2P55001 183 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R45P59539 299 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SGK494Q96LW2 274 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 RAB1BQ9H0U4 201 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FNDC10F2Z333 226 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TAX1BP3O14907 124 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ARL3P36405 182 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 GNG4P50150 75 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 ZNF137PP52743 207 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 SLC35B1P78383 322 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 FXYD3Q14802 87 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 CENPWQ5EE01 88 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MMD2Q8IY49 270 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 NRN1Q9NPD7 142 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC4-211ENST00000492996 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms