RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W YOL098CQ12496 1037 aa9.56□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W PRP9P19736 530 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W GYP6P32806 458 aa9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W MRP4P32902 394 aa9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W TGL4P36165 910 aa9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W QNS1P38795 714 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W CNN1P43618 361 aa9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W EMC4P53073 190 aa9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YLR046CQ12253 270 aa9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa9.55□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W DAL81P21657 970 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YKT6P36015 200 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W BCD1P38772 366 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YER130CP39959 443 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W AMA1P50082 593 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W PIR1Q03178 341 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W TRM82Q03774 444 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W SPO75Q07798 868 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W THI20Q08224 551 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W Q0182Q9ZZW1 134 aa9.54□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W GEX1P25596 615 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W GEX2P36173 615 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W DSN1P40568 576 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W KTR6P54070 446 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W DOS2P54858 310 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W INA17Q02888 182 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W YLR012CQ07927 99 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W MEC1P38111 2368 aa9.53□□□□□ -0.88
YLR349WYLR349W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W APL1P27351 700 aa9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W SRB2P34162 210 aa9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W KTR7P40504 517 aa9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W CIS3P47001 227 aa9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YPT11P48559 417 aa9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ARA2Q04212 335 aa9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ALR1Q08269 859 aa9.52□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W GAL4P04386 881 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W GPA1P08539 472 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W CYC8P14922 966 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W TRM1P15565 570 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W MET16P18408 261 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W CIN8P27895 1000 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W TAE1P38340 232 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W STL1P39932 569 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YER189WP40104 122 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ASG1P40467 964 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W PHO86P46956 311 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W COG7P53195 279 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YPL113CQ02961 396 aa9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YBR056W-AI2HB52 66 aa9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W CDC33P07260 213 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W STE4P18851 423 aa9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W RDS2P19541 446 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W VMA4P22203 233 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YJL070CP40361 888 aa9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W PUS2P53167 370 aa9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YNR063WP53749 607 aa9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ADI1Q03677 179 aa9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YML096WQ04489 525 aa9.5□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ENO1P00924 437 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W RIP1P08067 215 aa9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W BRF1P29056 596 aa9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W HOP2P53187 214 aa9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YGR266WP53326 701 aa9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W PRM1P53835 661 aa9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W AAD4Q07747 329 aa9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W KAR3P17119 729 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W MRC1P25588 1096 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W PMT1P33775 817 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W SNG1P46950 547 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W NBP35P52920 328 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W AIM14P53109 570 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YDR444WQ04093 687 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W ERF2Q06551 359 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W RTT10Q08924 1013 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W SUL2Q12325 893 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W YEL077CQ3E7X8 1277 aa9.48□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W CDC37P06101 506 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W SPT15P13393 240 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W EFM2P38347 419 aa9.47□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W EDC3P39998 551 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W FET5P43561 622 aa9.47□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W GNT1Q12096 491 aa9.47□□□□□ -0.89
YLR349WYLR349W RPS3P05750 240 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YLR349WYLR349W RRP3P38712 501 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YLR349WYLR349W LAM1P38851 1228 aa9.46□□□□□ -0.9
YLR349WYLR349W VAC8P39968 578 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.3 ms