RNA–Protein interactions for RNA: YLR132C

USB1, Transcript of Putative phosphodiesterase specific for U6 snRNA 3' end modification, yeast

Gene USB1, Length 873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
USB1	YLR132C	YJL206C	P39529	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	IES1	P43579	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	BIT61	P47041	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	TAF4	P50105	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YPS7	Q06325	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	TAF3	Q12297	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ATP4	P05626	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
USB1	YLR132C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	NIC96	P34077	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YKL133C	P36066	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	FLO10	P36170	1169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YHR033W	P38690	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SFB3	P38810	929 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
USB1	YLR132C	NDC80	P40460	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	VPS36	Q06696	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	STP4	Q07351	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	PRP28	P23394	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	DMC1	P25453	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	NTH1	P32356	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	UBS1	P38290	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	GET2	P40056	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YIL166C	P40445	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	BUD8	P41698	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SPO1	P53541	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	MPD2	Q99316	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	FHN1	P53279	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YNL034W	P53963	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YNL018C	P53976	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	THI22	Q06490	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	AIM41	Q12032	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ABF1	P14164	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	CDC26	P14724	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	IME1	P21190	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ATP12	P22135	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ADY2	P25613	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	HXT4	P32467	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	EMP70	P32802	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	PHO11	P35842	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SDS22	P36047	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	TAF5	P38129	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	COS111	P38308	924 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	PHO12	P38693	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	RIM4	P38741	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SAW1	P39735	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	STL1	P39932	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	TPM2	P40414	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	YIL077C	P40508	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	MDR1	P53258	950 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	ARO10	Q06408	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USB1	YLR132C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	BCS1	P32839	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	SEC6	P32844	805 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	YEL076C	P39971	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	IMO32	P53219	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	PTP2	P29461	750 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	PRE4	P30657	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	YPT7	P32939	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	GLG1	P36143	616 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	BDH2	P39713	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	ARG2	P40360	574 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	IRC5	P43610	853 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	TGL2	P54857	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	MLC2	Q06580	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	YFT2	Q06676	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	MLH3	Q12083	715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	PSF3	Q12146	194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	VPS5	Q92331	675 aa		4.82	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	KCC4	P25389	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	YIL092W	P40497	633 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	CTR1	P49573	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	MET14	Q02196	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	COQ11	Q05892	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	SEC12	P11655	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
USB1	YLR132C	PHO3	P24031	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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