RNA–Protein interactions for RNA: YLR079W

SIC1, Transcript of Cyclin-dependent kinase inhibitor (CKI), yeast

Gene SIC1, Length 855 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIC1	YLR079W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	TGS1	Q12052	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	LAM4	P38800	1345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	TGL1	P34163	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	TDP1	P38319	544 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	MUP3	P38734	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	YLF2	P38746	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	YDL183C	P48569	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	SNF12	P53628	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	TGL2	P54857	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	MFM1	Q02783	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	ARR3	Q06598	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SIC1	YLR079W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	SPO11	P23179	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	MRPL7	P36519	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	ASK10	P48361	1146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	MRK1	P50873	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	TIM50	Q02776	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	EHT1	P38295	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	YEL020C	P39994	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	MAD2	P40958	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	YNR071C	P53757	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	MLC2	Q06580	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	NUR1	Q12066	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	NYV1	Q12255	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	MPD2	Q99316	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	VPS34	P22543	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	PTP2	P29461	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	DSS4	P32601	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	CCL1	P37366	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	YMC2	P38087	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	RIM4	P38741	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	MET14	Q02196	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	ARP7	Q12406	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	STE4	P18851	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	BET2	P20133	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	CBP3	P21560	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	CNE1	P27825	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	YIP4	P53093	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	USA1	Q03714	838 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	IOC4	Q04213	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	CRD1	Q07560	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	DIN7	Q12086	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	URA3	P03962	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	TPK2	P06245	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	PCK1	P10963	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	ARG1	P22768	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	PAC2	P39937	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	GSM1	P42950	618 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	PIP2	P52960	996 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	BUD17	P53727	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	CPR8	P53728	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	PHO5	P00635	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	WHI2	P12611	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	TRS23	Q03784	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIC1	YLR079W	GAL1	P04385	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ADY2	P25613	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	SWD1	P39706	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	MIT1	P40002	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	VFA1	P40080	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	RAD26	P40352	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	COQ6	P53318	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	CTT1	P06115	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	EMP70	P32802	667 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	TEP1	P53916	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	CRT10	Q08226	957 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	SUT2	Q12286	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	ADH4	P10127	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	STE12	P13574	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	PPZ2	P33329	710 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	HIS6	P40545	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIC1	YLR079W	OPT1	P40897	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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