RNA–Protein interactions for RNA: YDL135C

RDI1, Transcript of Rho GDP dissociation inhibitor, yeast

Gene RDI1, Length 609 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDI1	YDL135C	MUK1	Q02866	612 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	HLR1	Q04429	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	AIM41	Q12032	185 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	SET3	P36124	751 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	YAP1802	P53309	568 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	RIA1	P53893	1110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	IZH3	Q07959	543 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	MCH5	Q08777	521 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	USV1	Q12132	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	HOS1	Q12214	470 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	SIN3	P22579	1536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	FUB1	P25659	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	CTP1	P38152	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	PCL5	P38794	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	ACA1	P39970	489 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	YGR021W	P53212	290 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	TOP1	P04786	769 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	MSH1	P25846	959 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	NTH1	P32356	751 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	UBS1	P38290	277 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	YGR151C	P53287	111 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	SSL2	Q00578	843 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	ACS1	Q01574	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	TRI1	Q05024	226 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	ARR3	Q06598	404 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	BPT1	P14772	1559 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RDI1	YDL135C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	PCK1	P10963	549 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	DBF20	P32328	564 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ELF1	P36053	145 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TAF5	P38129	798 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	APM3	P38153	483 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	YHL017W	P38745	532 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	LRO1	P40345	661 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	STB4	P50104	949 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	NMA2	P53204	395 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ATG4	P53867	494 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	PHO81	P17442	1178 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	VPS33	P20795	691 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	PPE1	P38796	400 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	SPC72	P39723	622 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	GSM1	P42950	618 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	UBA2	P52488	636 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ABF1	P14164	731 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	PTH2	P34222	208 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	MRPL7	P36519	292 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	STB5	P38699	743 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	YLF2	P38746	405 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	YJL193W	P39542	402 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	NDC80	P40460	691 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ERR3	P42222	437 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	DIP5	P53388	608 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	CIA1	Q05583	330 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ACF2	Q12168	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	UFD4	P33202	1483 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	SEC12	P11655	471 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	CTR1	P49573	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	SNF12	P53628	566 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	AAD4	Q07747	329 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	MSM1	P22438	575 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ARG2	P40360	574 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	ENT2	Q05785	613 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	RKI1	Q12189	258 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	SIR1	P21691	654 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	DSS4	P32601	143 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	APL3	P38065	1025 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	EXO84	P38261	753 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	POL31	P46957	487 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	COS12	P53053	380 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RDI1	YDL135C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.7 ms