RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	PET10	P36139	283 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SUL1	P38359	859 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	NPR3	P38742	1146 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	BCD1	P38772	366 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ASE1	P50275	885 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	VID30	P53076	958 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MDR1	P53258	950 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	GPA1	P08539	472 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
CPR4	YCR069W	GSY1	P23337	708 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ERG4	P25340	473 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TGL1	P34163	548 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MIC60	P36112	540 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	KTR4	P38131	464 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	CTF8	P38877	133 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	CBK1	P53894	756 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	CUR1	Q06469	252 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YOL073C	Q08232	322 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	OSH2	Q12451	1283 aa		5	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	GSY2	P27472	705 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	EUG1	P32474	517 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	OAR1	P35731	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	DID4	P36108	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SAP190	P36123	1033 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ERG7	P38604	731 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	GAA1	P39012	614 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YJL049W	P47048	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	UBA2	P52488	636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	RSC1	P53236	928 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
CPR4	YCR069W	COG4	Q06096	861 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	YLH47	Q06493	454 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TOP3	P13099	656 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	RGT1	P32862	1170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	MOH1	P38191	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TIM54	P47045	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
CPR4	YCR069W	COS5	P47187	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ERG5	P54781	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	GIS1	Q03833	894 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ENV7	Q12003	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ARP6	Q12509	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SRD1	P09007	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	PCK1	P10963	549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	RPC53	P25441	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	BUD2	P33314	1104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TFC4	P33339	1025 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TVP38	P36164	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	EFM2	P38347	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SMC3	P47037	1230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SHE10	P53075	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	PUS2	P53167	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ORC4	P54791	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	PLP2	Q12017	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	SWM1	Q12379	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	TRM13	Q12383	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPR4	YCR069W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CLN3	P13365	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	OM45	P16547	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CDC15	P27636	974 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CTF13	P35203	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	SIP3	P38717	1229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	YHR078W	P38799	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	CTM1	P38818	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	RNT1	Q02555	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	AIM33	Q04516	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPR4	YCR069W	MET7	Q08645	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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