RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FAM193AP78312 1265 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 HOOK2Q96ED9 719 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CUTAO60888 179 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NF2P35240 595 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 JDP2Q8WYK2 163 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CHST3Q7LGC8 479 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PLVAPQ9BX97 442 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH1B1P30837 517 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM14Q14142 442 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TAF3Q5VWG9 929 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 BICD1Q96G01 975 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 USP44Q9H0E7 712 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 B4E1Z4 1266 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF853P0CG23 659 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ISM2Q6H9L7 571 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PAF1Q8N7H5 531 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FAM227BQ96M60 508 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 HAUS7Q99871 368 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CENPHQ9H3R5 247 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 STAP2Q9UGK3 403 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD62A6NC57 917 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MCM7P33993 719 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ANO1Q5XXA6 986 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SHTN1A0MZ66 631 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC175P0C221 793 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SKILP12757 684 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TICAM2Q86XR7 235 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CEP112Q8N8E3 955 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 USP21Q9UK80 565 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 RIMBP2O15034 1052 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FAM13AO94988 1023 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ATG3Q9NT62 314 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SV2BQ7L1I2 683 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CLCN1P35523 988 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MCTP2Q6DN12 878 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 RGS12O14924 1447 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GNG11P61952 73 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 WDR78Q5VTH9 848 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 E7EWF7 191 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 AKR1B10O60218 316 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PPFIA3O75145 1194 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MYL5Q02045 173 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 H0YIN7 160 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TACC1O75410 805 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 PDE6BP35913 854 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 USP8P40818 1118 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZAP70P43403 619 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 VEZTQ9HBM0 779 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 COPRSQ9NQ92 184 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SEMA3EO15041 775 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CNGA4Q8IV77 575 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MED23Q9ULK4 1368 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NEK11Q8NG66 645 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 SPAG5Q96R06 1193 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 JADE2Q9NQC1 790 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF445P59923 1031 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-228ENST00000636120 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms