RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		33.45	■■■□□ 2.95
LYNX1-208	ENST00000615007	TFCP2	Q12800	502 aa		33.45	■■■□□ 2.95
LYNX1-208	ENST00000615007	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		33.45	■■■□□ 2.95
LYNX1-208	ENST00000615007	AK9	Q5TCS8	1911 aa		33.45	■■■□□ 2.95
LYNX1-208	ENST00000615007	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	TIMM10	P62072	90 aa		33.44	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM151A	Q8WW52	585 aa		33.44	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	SLF2	Q8IX21	1173 aa		33.43	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		33.43	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	XAGE2	Q96GT9	111 aa		33.43	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	WRNIP1	Q96S55	665 aa		33.43	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	GTF2A2	P52657	109 aa		33.42	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	RASGRF1	Q13972	1273 aa		33.42	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		33.42	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		33.41	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		33.41	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		33.4	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	OTUD5	Q96G74	571 aa		33.4	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		33.4	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		33.4	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		33.39	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	GORAB	Q5T7V8	394 aa		33.39	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	ERO1B	Q86YB8	467 aa		33.39	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	USP40	Q9NVE5	1235 aa		33.39	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	ABCF2	Q9UG63	623 aa		33.39	■■■□□ 2.94
LYNX1-208	ENST00000615007	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		33.38	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		33.38	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	TCP10	Q12799	353 aa		33.37	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		33.37	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		33.37	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	GAK	O14976	1311 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	CRHR2	Q13324	411 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	CCL15	Q16663	113 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	ERO1A	Q96HE7	468 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPN18	Q99952	460 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	DOCK2	Q92608	1830 aa		33.36	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	NFIA	Q12857	509 aa		33.34	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		33.34	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		33.34	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		33.34	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	CETP	P11597	493 aa		33.33	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		33.33	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		33.33	■■■□□ 2.93
LYNX1-208	ENST00000615007	PPIL2	Q13356	520 aa		33.32	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	POLA2	Q14181	598 aa		33.32	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	IDI2	Q9BXS1	227 aa		33.32	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		33.32	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	ENTPD3	O75355	529 aa		33.31	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	SNAPC2	Q13487	334 aa		33.31	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	SPATA5	Q8NB90	893 aa		33.31	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	ATP8B2	P98198	1209 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	PPAT	Q06203	517 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	SSH3	Q8TE77	659 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	GPR108	Q9NPR9	543 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM17	Q9Y577	477 aa		33.3	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	SOX10	P56693	466 aa		33.29	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	GSTO1	P78417	241 aa		33.29	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	SP3	Q02447	781 aa		33.29	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		33.29	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	IRF6	O14896	467 aa		33.28	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	INPP5B	P32019	993 aa		33.28	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	BTD	P43251	543 aa		33.28	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	RGS3	P49796	1198 aa		33.28	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		33.28	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	LDHC	P07864	332 aa		33.27	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	MECOM	Q03112	1051 aa		33.27	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		33.27	■■■□□ 2.92
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGEF6	Q15052	776 aa		33.26	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		33.26	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	TNNI3K	Q59H18	835 aa		33.25	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		33.25	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		33.25	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		33.25	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		33.24	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	RLBP1	P12271	317 aa		33.24	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		33.24	■■■□□ 2.91
LYNX1-208	ENST00000615007	MCAM	P43121	646 aa		33.23	■■■□□ 2.91

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