RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDX5P30044 214 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXL16Q8N461 479 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 PIM2Q9P1W9 311 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNA1SQ13698 1873 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2IP78347 998 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXW7Q969H0 707 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP4CP60510 307 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 HAND2P61296 217 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 MTA3Q9BTC8 594 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXP2O15409 715 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZUG5 572 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMD1Q99460 953 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF3AQ9Y496 699 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMA4Q16363 1823 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-212ENST00000591041 CPA1P15085 419 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 USP5P45974 858 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM87BQ96K49 555 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 SLX4Q8IY92 1834 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 DPEP1P16444 411 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PTMSP20962 102 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 GBP4Q96PP9 640 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 JAG2Q9Y219 1238 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ERICH2A1L162 156 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PRC1O43663 620 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 C21orf2O43822 256 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIN3BO60391 1043 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 DDIT3P35638 169 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PDCP20941 246 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PPARAQ07869 468 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 DOK7Q18PE1 504 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 SBK1Q52WX2 424 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0G2JLW4 131 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L3A6NCW0 530 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L4A6NCW7 530 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PPIP5K2O43314 1243 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKAB2O43741 272 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ECE2O60344 883 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TMTC2Q8N394 836 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ESR2Q92731 530 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 MRIQ9BWK5 157 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE4BQ07343 736 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 BRF1Q92994 677 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TOMM22Q9NS69 142 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 BTDP43251 543 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TEKT1Q969V4 418 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-212ENST00000591041 GAKO14976 1311 aa26.64■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.854e-7■■■■□ 21.1
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 IFFO2Q5TF58 517 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-212ENST00000591041 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.63■■□□□ 1.85
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