RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TIMM10P62072 90 aa21.68■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TEKT1Q969V4 418 aa21.68■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 MRIQ9BWK5 157 aa21.68■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 ADORA1P30542 326 aa21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TFCP2Q12800 502 aa21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 CCL15Q16663 113 aa21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 PHKA1P46020 1223 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TNFAIP1Q13829 316 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 CEP290O15078 2479 aa21.66■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 RLBP1P12271 317 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 VGLL4Q14135 290 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 NBPF11Q86T75 865 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 OTUD5Q96G74 571 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 TEPSINQ96N21 525 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.65■■□□□ 1.06
RNPS1-222ENST00000567147 MAST3O60307 1309 aa21.64■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 H0YGN5 161 aa21.64■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC102BQ68D86 513 aa21.64■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.64■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.64■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.63■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 A0A1B0GUL7 405 aa21.63■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 SEMA3EO15041 775 aa21.63■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 GTF2A2P52657 109 aa21.63■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.63■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 SZT2Q5T011 3432 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 TNNI2P48788 182 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 CACNB3P54284 484 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 MAP3K9P80192 1104 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 XAGE2Q96GT9 111 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.62■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 PRDX5P30044 214 aa21.61■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 ATP8B2P98198 1209 aa21.61■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGEF6Q15052 776 aa21.61■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.055e-8■■□□□ 11.6
RNPS1-222ENST00000567147 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.61■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 CSADQ9Y600 493 aa21.61■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 ZBTB22O15209 634 aa21.6■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 POLA2Q14181 598 aa21.6■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.6■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.6■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.59■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 RASGRF1Q13972 1273 aa21.59■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 PANK1Q8TE04 598 aa21.59■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 SSH3Q8TE77 659 aa21.59■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.58■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.58■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.58■■□□□ 1.05
RNPS1-222ENST00000567147 BTBD19C9JJ37 291 aa21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 GORABQ5T7V8 394 aa21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 FAM83AQ86UY5 434 aa21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.57■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.56■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 TLR2O60603 784 aa21.56■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 KIF22Q14807 665 aa21.56■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 MTFR1Q15390 333 aa21.56■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.56■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 CETPP11597 493 aa21.55■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 DPF3Q92784 378 aa21.55■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 WRNIP1Q96S55 665 aa21.55■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 USP40Q9NVE5 1235 aa21.55■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 ABCF2Q9UG63 623 aa21.55■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 IRF6O14896 467 aa21.54■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 MS4A1P11836 297 aa21.54■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 CTGFP29279 349 aa21.54■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
RNPS1-222ENST00000567147 SHISA4Q96DD7 197 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms