RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAST3O60307 1309 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BRCA2P51587 3418 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BCAMP50895 628 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM83AQ86UY5 434 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BRI3BPQ8WY22 251 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF521Q96K83 1311 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF16BQ96L93 1317 aa11.79□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NBPF11Q86T75 865 aa11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERO1BQ86YB8 467 aa11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CETPP11597 493 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FGFR2P21802 821 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CACNB3P54284 484 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DCAF15Q66K64 600 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WDR66Q8TBY9 1149 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WRNIP1Q96S55 665 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 USP44Q9H0E7 712 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.77□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AK9Q5TCS8 1911 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TLR2O60603 784 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAP1Q01518 475 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNAPC2Q13487 334 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF22Q14807 665 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LPIN2Q92539 896 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF333Q96JL9 665 aa11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 E9PSI1 815 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EYA2O00167 538 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IRF6O14896 467 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GNRH1P01148 92 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC5A1P13866 664 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EN2P19622 333 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPATQ06203 517 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPIL2Q13356 520 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM151AQ8WW52 585 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SSH1Q8WYL5 1049 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC39A7Q92504 469 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BTBD19C9JJ37 291 aa11.74□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C7P10643 843 aa11.74□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.74□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FBXO3Q9UK99 471 aa11.74□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRMT2P55345 433 aa11.73□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.73□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.73□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CIAO1O76071 339 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INPP5BP32019 993 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLFN5Q08AF3 891 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa11.72□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATP2B3Q16720 1220 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C17orf99Q6UX52 265 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DENND2AQ9ULE3 1009 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.71□□□□□ -0.53
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.7□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PDHXO00330 501 aa11.7□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SEMA3EO15041 775 aa11.7□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HOXD10P28358 340 aa11.7□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRDX5P30044 214 aa11.7□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TCP10Q12799 353 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms