RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 MIER1Q8N108 512 aa30.2■■■□□ 2.43
SIMC1-211ENST00000514128 OTUD5Q96G74 571 aa30.2■■■□□ 2.43
SIMC1-211ENST00000514128 HPS5Q9UPZ3 1129 aa30.2■■■□□ 2.43
SIMC1-211ENST00000514128 TNNQ9UQP3 1299 aa30.19■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 A0A1B0GUL7 405 aa30.18■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 GTF2A2P52657 109 aa30.18■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 SOX10P56693 466 aa30.18■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 TFCP2Q12800 502 aa30.18■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 TIMM10P62072 90 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 CRHR2Q13324 411 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 RASGRF1Q13972 1273 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa30.17■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 TCP10Q12799 353 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 CCL15Q16663 113 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 FAM151AQ8WW52 585 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 DOCK2Q92608 1830 aa30.15■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 ZBTB22O15209 634 aa30.15■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 XAGE2Q96GT9 111 aa30.15■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 ABCF2Q9UG63 623 aa30.15■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.15■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 GORABQ5T7V8 394 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 ERO1BQ86YB8 467 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 SLF2Q8IX21 1173 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 ERO1AQ96HE7 468 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 NEUROD6Q96NK8 337 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 PTPN18Q99952 460 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 USP40Q9NVE5 1235 aa30.14■■■□□ 2.42
SIMC1-211ENST00000514128 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.13■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 TRIM17Q9Y577 477 aa30.13■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 NFIAQ12857 509 aa30.12■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 MIGA2Q7L4E1 593 aa30.12■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.11■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 CETPP11597 493 aa30.1■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 GAKO14976 1311 aa30.09■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 PPIL2Q13356 520 aa30.09■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 SNAPC2Q13487 334 aa30.09■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa30.09■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 SP3Q02447 781 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 OTOP1Q7RTM1 612 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 CD99L2Q8TCZ2 262 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 FAM198AQ9UFP1 575 aa30.08■■■□□ 2.41
SIMC1-211ENST00000514128 INPP5BP32019 993 aa30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.07■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 IRF6O14896 467 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 RGS3P49796 1198 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ENTPD3O75355 529 aa30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 PPATQ06203 517 aa30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 SPATA5Q8NB90 893 aa30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 BTDP43251 543 aa30.04■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 IDI2Q9BXS1 227 aa30.04■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 EFCC1Q9HA90 598 aa30.04■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 HMG20BQ9P0W2 317 aa30.04■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 MECOMQ03112 1051 aa30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF6Q15052 776 aa30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 RFX7Q2KHR2 1363 aa30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 GSTO1P78417 241 aa30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 C1orf115Q9H7X2 142 aa30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF112Q9UJU3 913 aa30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-211ENST00000514128 MAST2Q6P0Q8 1798 aa30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 PICALMQ13492 652 aa30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 POLA2Q14181 598 aa30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 PI16Q6UXB8 463 aa30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 ZFPM1Q8IX07 1006 aa30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 RAI14Q9P0K7 980 aa30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 BTBD19C9JJ37 291 aa30■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 LDHCP07864 332 aa30■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 SSH3Q8TE77 659 aa30■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SIMC1-211ENST00000514128 ATP8B2P98198 1209 aa29.99■■■□□ 2.39
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