RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 PGBD1Q96JS3 809 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 ESPNB1AK53 854 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 UVSSAQ2YD98 709 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 APOA5Q6Q788 366 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 BICD2Q8TD16 824 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 KDM4AO75164 1064 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CDKL5O76039 1030 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CERKQ8TCT0 537 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 LY9Q9HBG7 655 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 INCENPQ9NQS7 918 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 HSPA1LP34931 641 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 DACT1Q9NYF0 836 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CACNA1SQ13698 1873 aa20.06■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 ZBTB43O43298 467 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 LIFRP42702 1097 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 MAP3K11Q16584 847 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 RGS22Q8NE09 1264 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 SENP2Q9HC62 589 aa20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 KLRK1P26718 216 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 TM4SF1P30408 202 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 USP28Q96RU2 1077 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC192P0DO97 292 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 HS1BP3Q53T59 392 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 MICU3Q86XE3 530 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 TNMDQ9H2S6 317 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 TOMM22Q9NS69 142 aa20.04■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC69A6NI79 296 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 ADRA2BP18089 450 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 PPARAQ07869 468 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 NFIXQ14938 502 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.81e-15■□□□□ 8.7
FAAP20-211ENST00000469733 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 RXRAP19793 462 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CAMK4Q16566 473 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 CNBD1Q8NA66 436 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 MTA3Q9BTC8 594 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.02■□□□□ 0.8
FAAP20-211ENST00000469733 NR1I2O75469 434 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 CDC27P30260 824 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 BRAPQ7Z569 592 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 CLCN1P35523 988 aa20.01■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 ALG1Q9BT22 464 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 ERICH2A1L162 156 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 WTAPQ15007 396 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 MYL10Q9BUA6 226 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 BRIP1Q9BX63 1249 aa20■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 NID2Q14112 1375 aa19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 IARSP41252 1262 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 GRAPQ13588 217 aa19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 ZSCAN30Q86W11 494 aa19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF384Q8TF68 577 aa19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.99■□□□□ 0.79
FAAP20-211ENST00000469733 MAST2Q6P0Q8 1798 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms