RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 BTDP43251 543 aa28.97■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.97■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 APPP05067 770 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 BAG3O95817 575 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 ANAPC15P60006 121 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 TEKT1Q969V4 418 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 IL17RAQ96F46 866 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 MRIQ9BWK5 157 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.96■■■□□ 2.23
NME4-209ENST00000460297 CRKP46108 304 aa28.95■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 ALX1Q15699 326 aa28.95■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.95■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 CYP21A2P08686 494 aa28.94■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 TNIP1Q15025 636 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 GPR162Q16538 588 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 RHBDL3P58872 404 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 RNF20Q5VTR2 975 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 ZMYM6O95789 1325 aa28.93■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 LAMA4Q16363 1823 aa28.92■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 CERS3Q8IU89 383 aa28.92■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.92■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.91■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 NAPBQ9H115 298 aa28.91■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 FOCADQ5VW36 1801 aa28.91■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.91■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.9■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.9■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.9■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 PLCG2P16885 1265 aa28.89■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.89■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
NME4-209ENST00000460297 TDO2P48775 406 aa28.89■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.89■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 RNF181Q9P0P0 153 aa28.89■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 USP17L8P0C7I0 530 aa28.88■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 HAND2P61296 217 aa28.88■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.88■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.87■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 TEX11Q8IYF3 940 aa28.87■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.87■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 CFAP100Q494V2 611 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 OGFOD1Q8N543 542 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 NBPF3Q9H094 633 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 ZNF213O14771 459 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 USP5P45974 858 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 RABEP1Q15276 862 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 USP40Q9NVE5 1235 aa28.86■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.85■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 SHTN1A0MZ66 631 aa28.84■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 GRIN3BO60391 1043 aa28.84■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 LAMB1P07942 1786 aa28.84■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 CTR9Q6PD62 1173 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 DPF2Q92785 391 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.83■■■□□ 2.21
NME4-209ENST00000460297 MYH1P12882 1939 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 USP17L12C9JPN9 530 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 USP17L21D6R901 530 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 E7EWF7 191 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 SMIM22K7EJ46 135 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 SPDYE6P0CI01 402 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 KRT32Q14532 448 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 FLT1P17948 1338 aa28.82■■■□□ 2.2
NME4-209ENST00000460297 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms