RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WRNIP1Q96S55 665 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM151AQ8WW52 585 aa32.48■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDYE5A6NIY4 337 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB22O15209 634 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMM10P62072 90 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL15Q16663 113 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRI3BPQ8WY22 251 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNNQ9UQP3 1299 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa32.47■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERO1AQ96HE7 468 aa32.46■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKAP2Q9Y2D5 859 aa32.46■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM17Q9Y577 477 aa32.46■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAI2P04899 355 aa32.45■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFCP2Q12800 502 aa32.45■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERO1BQ86YB8 467 aa32.45■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF341Q9BYN7 854 aa32.45■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GUL7 405 aa32.44■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCP10Q12799 353 aa32.44■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTOP1Q7RTM1 612 aa32.44■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLUAP1Q96AJ1 413 aa32.44■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP40Q9NVE5 1235 aa32.44■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASGRF1Q13972 1273 aa32.43■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIGA2Q7L4E1 593 aa32.43■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFIAQ12857 509 aa32.42■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD99L2Q8TCZ2 262 aa32.42■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XAGE2Q96GT9 111 aa32.42■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP3Q02447 781 aa32.41■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MVPQ14764 893 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CETPP11597 493 aa32.4■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa32.4■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM198AQ9UFP1 575 aa32.4■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCF2Q9UG63 623 aa32.4■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIL2Q13356 520 aa32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEUROD6Q96NK8 337 aa32.39■■■□□ 2.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AK9Q5TCS8 1911 aa32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF6O14896 467 aa32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPP5BP32019 993 aa32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNAPC2Q13487 334 aa32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLF2Q8IX21 1173 aa32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIER1Q8N108 512 aa32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH2Q9UKX2 1941 aa32.38■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAKO14976 1311 aa32.37■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCC1Q9HA90 598 aa32.37■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF112Q9UJU3 913 aa32.37■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa32.36■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPATQ06203 517 aa32.36■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM57Q8N5G2 664 aa32.36■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GORABQ5T7V8 394 aa32.35■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN22Q9Y2R2 807 aa32.35■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFPM1Q8IX07 1006 aa32.34■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDI2Q9BXS1 227 aa32.34■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTBD19C9JJ37 291 aa32.33■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENTPD3O75355 529 aa32.33■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS3P49796 1198 aa32.33■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTTP42858 3142 aa32.33■■■□□ 2.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERICH6Q7L0X2 663 aa32.32■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF6Q15052 776 aa32.31■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMG20BQ9P0W2 317 aa32.31■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa32.31■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa32.3■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTDP43251 543 aa32.3■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAP1Q01518 475 aa32.3■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MECOMQ03112 1051 aa32.3■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA5Q8NB90 893 aa32.3■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLR2O60603 784 aa32.29■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFX7Q2KHR2 1363 aa32.29■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOCK2Q92608 1830 aa32.28■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNH4Q9UQ05 1017 aa32.28■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATRNL1Q5VV63 1379 aa32.28■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PI16Q6UXB8 463 aa32.27■■■□□ 2.76
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLA2Q14181 598 aa32.26■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa32.26■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa32.25■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa32.25■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTO1P78417 241 aa32.25■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PICALMQ13492 652 aa32.25■■■□□ 2.75
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms