RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 TNIP1Q15025 636 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 RASEFQ8IZ41 740 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 TEKT1Q969V4 418 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 GAKO14976 1311 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 FOXP2O15409 715 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 NAPBQ9H115 298 aa23.29■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 PSMD14O00487 310 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 PRKAB2O43741 272 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 BTDP43251 543 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.28■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 ZMYM6O95789 1325 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF213O14771 459 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 PSMA5P28066 241 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 TDO2P48775 406 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 CXCL9Q07325 125 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.27■■□□□ 1.32
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP21A2P08686 494 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 LMNB1P20700 586 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 SCNN1DP51172 638 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.26■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 BECN1Q14457 450 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.25■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 USP5P45974 858 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 CRKP46108 304 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 OGFOD1Q8N543 542 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 FZD9O00144 591 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 ST18O60284 1047 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 MMP14P50281 582 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 GMLQ99445 158 aa23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 COL4A5P29400 1685 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 NEK4P51957 841 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 TEX11Q8IYF3 940 aa23.23■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 SCN9AQ15858 1988 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 PRELPP51888 382 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 SNX21Q969T3 373 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.22■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L8P0C7I0 530 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 HAND2P61296 217 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 USP40Q9NVE5 1235 aa23.21■■□□□ 1.31
VSTM2B-201ENST00000335523 E7EWF7 191 aa23.2■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 RHBDL3P58872 404 aa23.2■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.2■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.2■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.2■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 NEK1Q96PY6 1258 aa23.2■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 HSCBQ8IWL3 235 aa23.19■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.19■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 TRDNQ13061 729 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 CFAP100Q494V2 611 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 SBK1Q52WX2 424 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 RUFY3Q7L099 469 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.18■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L12C9JPN9 530 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 USP17L21D6R901 530 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 MCM2P49736 904 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 PPARAQ07869 468 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 CTR9Q6PD62 1173 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 DLGAP5Q15398 846 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 DPF2Q92785 391 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM2B-201ENST00000335523 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms