RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 JAG2Q9Y219 1238 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 MBD3O95983 291 aa23.57■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.56■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.56■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 BBOX1O75936 387 aa23.55■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 UFL1O94874 794 aa23.55■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 LAMB1P07942 1786 aa23.54■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 TMEM87BQ96K49 555 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.53■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.53■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 SENP2Q9HC62 589 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 PPFIA3O75145 1194 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 ATP2B4P23634 1241 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 KRT23Q9C075 422 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 LY9Q9HBG7 655 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 GGA1Q9UJY5 639 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
UBXN6-201ENST00000301281 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBXN6-201ENST00000301281 IFFO2Q5TF58 517 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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UBXN6-201ENST00000301281 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 KIF3AQ9Y496 699 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF445P59923 1031 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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UBXN6-201ENST00000301281 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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UBXN6-201ENST00000301281 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 TMC4Q7Z404 712 aa23.49■■□□□ 1.35
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UBXN6-201ENST00000301281 KRT85P78386 507 aa23.48■■□□□ 1.35
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UBXN6-201ENST00000301281 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 IL1R1P14778 569 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 UBE2HP62256 183 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 MSL1Q68DK7 614 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 IGSF3O75054 1194 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.351e-5■■■□□ 14.9
UBXN6-201ENST00000301281 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.355e-7■■□□□ 13
UBXN6-201ENST00000301281 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBXN6-201ENST00000301281 TOMM22Q9NS69 142 aa23.47■■□□□ 1.35
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