RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 FSD2A1L4K1 749 aa26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 ATP2B4P23634 1241 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 GGA1Q9UJY5 639 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 KDM4AO75164 1064 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 MMP10P09238 476 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 PPARAQ07869 468 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 SENP2Q9HC62 589 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 MSL1Q68DK7 614 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TCHHQ07283 1943 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 FIBPO43427 364 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM22K7EJ46 135 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM87BQ96K49 555 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 POLLQ9UGP5 575 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 KRT23Q9C075 422 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 H3BQV1 296 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 MBD3O95983 291 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 FOSBP53539 338 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 IFFO2Q5TF58 517 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TOMM22Q9NS69 142 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.72■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.72■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 CD209Q9NNX6 404 aa26.72■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.72■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 SRGNP10124 158 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 GRIK5Q16478 980 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 LY9Q9HBG7 655 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.7■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
VSTM4-201ENST00000298454 CHD4Q14839 1912 aa26.7■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 SP8Q8IXZ3 490 aa26.7■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf229H3BNL8 230 aa26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 RXRAP19793 462 aa26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 APOA5Q6Q788 366 aa26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 KIF3AQ9Y496 699 aa26.69■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 RESTQ13127 1097 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 IL1R1P14778 569 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 CTR9Q6PD62 1173 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 TMC4Q7Z404 712 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 NPR1P16066 1061 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 CPLX1O14810 134 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 LIFRP42702 1097 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 KRT85P78386 507 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 OLFM4Q6UX06 510 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 MICU3Q86XE3 530 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms