RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A9Q96Q91 983 aa32.45■■■□□ 2.79
UBP1-201ENST00000283628 TOM1O60784 492 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 PFKFB1P16118 471 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 NBPF11Q86T75 865 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D10CQ8IV04 446 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 ALG1Q9BT22 464 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 PTPN14Q15678 1187 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 JMYQ8N9B5 988 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 GJB4Q9NTQ9 266 aa32.44■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 PPP6R2O75170 966 aa32.43■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa32.43■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa32.43■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 PDE8BO95263 885 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 CYB5R4Q7L1T6 521 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 SLIT2O94813 1529 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 HLFQ16534 295 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 APOA5Q6Q788 366 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 SYNE4Q8N205 404 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 CCDC150Q8NCX0 1101 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 FBXW7Q969H0 707 aa32.42■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 ARAP2Q8WZ64 1704 aa32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 ALX1Q15699 326 aa32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 ZNF532Q9HCE3 1301 aa32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 VPS37DQ86XT2 251 aa32.41■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 ECM29Q5VYK3 1845 aa32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 USP27XA6NNY8 438 aa32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 IKBKBO14920 756 aa32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 IDH1O75874 414 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 APPP05067 770 aa32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 PDE6AP16499 860 aa32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 GPTP24298 496 aa32.4■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 PIP4K2BP78356 416 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 DDB1Q16531 1140 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 KRT40Q6A162 431 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 LRP5O75197 1615 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 CCDC102BQ68D86 513 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 SGMS1Q86VZ5 419 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 HPSEQ9Y251 543 aa32.39■■■□□ 2.78
UBP1-201ENST00000283628 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 PDE8AO60658 829 aa32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB43O43298 467 aa32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 SYKP43405 635 aa32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 KCNJ6P48051 423 aa32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 TUBE1Q9UJT0 475 aa32.38■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 SMC2O95347 1197 aa32.37■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa32.37■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 IFNKQ9P0W0 207 aa32.37■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 NCAPHQ15003 741 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 FEZ1Q99689 392 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 DENND2AQ9ULE3 1009 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 NUP98P52948 1817 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 STK36Q9NRP7 1315 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 B4E1Z4 1266 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.778e-7■■■□□ 17.5
UBP1-201ENST00000283628 TRIM29Q14134 588 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 PTPAQ15257 358 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 LPIN2Q92539 896 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 ZNF592Q92610 1267 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 AIDAQ96BJ3 306 aa32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 MROH5Q6ZUA9 1318 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 CDC27P30260 824 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 PHKA1P46020 1223 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 BARGINQ6ZT62 677 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 AIFM3Q96NN9 605 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 CHD4Q14839 1912 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 DOCK2Q92608 1830 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 KAT6BQ8WYB5 2073 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 BIN1O00499 593 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 IARSP41252 1262 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 LIFRP42702 1097 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 NTRK3Q16288 839 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K14Q99558 947 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 LY9Q9HBG7 655 aa32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
UBP1-201ENST00000283628 NRDCO43847 1150 aa32.34■■■□□ 2.77
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