RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Otop3Q80UF9 577 aa23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gpr108Q91WD0 569 aa23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 ZwintQ9CQU5 252 aa23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gadd45bP22339 160 aa23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trim59Q922Y2 403 aa23.06■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 XpcP51612 930 aa23.05■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myl10Q62082 202 aa23.05■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Insm1Q63ZV0 521 aa23.05■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Skor1Q8BX46 964 aa23.05■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cnnm2Q3TWN3 875 aa23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tango6Q8C3S2 1079 aa23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tnni2P13412 182 aa23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tpcn2Q8BWC0 731 aa23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Jag1Q9QXX0 1218 aa23.04■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sall1Q9ER74 1322 aa23.03■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cyp26a1O55127 497 aa23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr93Q402B2 695 aa23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc66Q6NS45 935 aa23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr19Q3UGF1 1341 aa23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp4cP97470 307 aa23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sirt2Q8VDQ8 389 aa23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myoz2Q9JJW5 264 aa23.02■■□□□ 1.28
Msx1-201ENSMUST00000063116 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa23.01■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rnf41Q8BH75 317 aa23.01■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa23.01■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abl1P00520 1123 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nell2Q61220 819 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hps6Q8BLY7 805 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 DymQ8CHY3 669 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rgs12Q8CGE9 1381 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp17lbE9Q9U0 468 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 ImpactO55091 318 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rpusd2Q149F1 553 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ehmt1Q5DW34 1296 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ano1Q8BHY3 960 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 IarsQ8BU30 1262 aa23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Csf1rP09581 977 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Terf1P70371 421 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Babam1Q3UI43 333 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 AsnsQ61024 561 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mxd3Q80US8 206 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 9230110C19RikQ8CC70 267 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Stn1Q8K2X3 378 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lamb1P02469 1786 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Psme4Q5SSW2 1843 aa22.99■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 FosbP13346 338 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 EgfrQ01279 1210 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp2b4Q6Q477 1205 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ttll4Q80UG8 1193 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Bola3Q8CEI1 110 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Paf1Q8K2T8 535 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Suclg2Q9Z2I8 433 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 TrdnE9Q9K5 693 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mtx1P47802 317 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sec23aQ01405 765 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cep63Q3UPP8 700 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Terb1Q8C0V1 768 aa22.98■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ltbp2O08999 1813 aa22.97■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Llgl2Q3TJ91 1027 aa22.97■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kifc2O08672 792 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 SrprbP47758 269 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ecm29Q6PDI5 1840 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Metap2O08663 478 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 PcQ05920 1178 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ifit1Q64282 463 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmx3Q8BXZ1 456 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp317Q8C0Q5 607 aa22.96■■□□□ 1.27
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp646Q6NV66 1788 aa22.95■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa22.95■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa22.95■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cnpy3Q9DAU1 276 aa22.95■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ptf1aQ9QX98 324 aa22.95■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm9992B2RWK3 458 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Me1P06801 572 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cd22P35329 862 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Unc93aQ710D3 458 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 VmacQ8BP01 174 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myl6bQ8CI43 207 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gpr101Q80T62 511 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ankrd13aQ80UP5 588 aa22.94■■□□□ 1.26
Msx1-201ENSMUST00000063116 Terf2ipQ91VL8 393 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.3 ms