RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myh2G3UW82 1942 aa7.61□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CpdO89001 1377 aa7.61□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lipo1J3QME6 396 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Metap2O08663 478 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl2c1Q5SVL9 228 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BcanQ61361 883 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acap3Q6NXL5 833 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tgs1Q923W1 853 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Appbp2Q9DAX9 585 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dctpp1Q9QY93 170 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nek3Q9R0A5 511 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dapk3O54784 448 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Edrf1Q6GQV7 1239 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssfa2Q922B9 1252 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp4r3bQ922R5 820 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ciao1Q99KN2 339 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam213aQ9CYH2 218 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col3a1P08121 1464 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp8b5A3FIN4 1183 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Capn2O08529 700 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Me1P06801 572 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2d9P11714 504 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EmbP21995 330 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tshz1Q5DTH5 1084 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bag1Q60739 355 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam1aQ60813 791 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myl10Q62082 202 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt39Q6IFX4 482 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf653Q6YND2 615 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Haus7Q8BKT8 364 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Maats1Q8BRC6 783 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl30Q8C3F7 581 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Emilin1Q99K41 1017 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sept12Q9D451 317 aa7.6□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5624F6ZZG8 207 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TsksO54887 585 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Card10P58660 1021 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a6Q64435 531 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tpm4Q6IRU2 248 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps37dQ810I0 261 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nek9Q8K1R7 984 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem132aQ922P8 1018 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ehd4Q9EQP2 541 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10134F6ZQC6 126 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef16Q3U5C8 713 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PsdQ5DTT2 1024 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam170aQ66LM6 333 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slain2Q8CI08 581 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubgcp2Q921G8 905 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubb4aQ9D6F9 444 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb43Q9DAI4 467 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myo3bQ1EG27 1305 aa7.59□□□□□ -1.19
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grin1P35438 938 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gng11P61953 73 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep63Q3UPP8 700 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mctp2Q5RJH2 878 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q66JV7 365 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ncoa7Q6DFV7 943 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RgmbQ7TQ33 436 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IqcgQ80W32 419 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Larp6Q8BN59 492 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zkscan8Q8BSL0 588 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bola3Q8CEI1 110 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Desi2Q9D291 194 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcl9Q9D219 1425 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf326O88291 580 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NefhP19246 1090 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde6aP27664 859 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ftl2P49945 183 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ric8aQ3TIR3 530 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb7bQ64321 544 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctdspl2Q8BG15 465 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ints5Q8CHT3 1018 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NenfQ9CQ45 171 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lonp2Q9DBN5 852 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nyap1Q6PFX7 833 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Asnsd1Q8BFS9 627 aa7.58□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35 ms