Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
EmbP21995 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EmbP21995 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
EmbP21995 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36■■■■□ 3.35
EmbP21995 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
EmbP21995 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
EmbP21995 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
EmbP21995 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EmbP21995 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
EmbP21995 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EmbP21995 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EmbP21995 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EmbP21995 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EmbP21995 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EmbP21995 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EmbP21995 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
EmbP21995 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
EmbP21995 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
EmbP21995 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EmbP21995 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
EmbP21995 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
EmbP21995 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
EmbP21995 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EmbP21995 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EmbP21995 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EmbP21995 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EmbP21995 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EmbP21995 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
EmbP21995 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EmbP21995 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EmbP21995 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
EmbP21995 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
EmbP21995 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EmbP21995 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
EmbP21995 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
EmbP21995 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EmbP21995 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EmbP21995 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
EmbP21995 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
EmbP21995 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
EmbP21995 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EmbP21995 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EmbP21995 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EmbP21995 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EmbP21995 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EmbP21995 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
EmbP21995 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EmbP21995 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EmbP21995 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EmbP21995 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EmbP21995 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EmbP21995 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EmbP21995 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EmbP21995 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EmbP21995 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
EmbP21995 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EmbP21995 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EmbP21995 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EmbP21995 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EmbP21995 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EmbP21995 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EmbP21995 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EmbP21995 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EmbP21995 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
EmbP21995 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
EmbP21995 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EmbP21995 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
EmbP21995 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
EmbP21995 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EmbP21995 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EmbP21995 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EmbP21995 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EmbP21995 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EmbP21995 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EmbP21995 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EmbP21995 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EmbP21995 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EmbP21995 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EmbP21995 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EmbP21995 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
EmbP21995 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EmbP21995 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EmbP21995 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EmbP21995 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EmbP21995 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EmbP21995 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EmbP21995 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
EmbP21995 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EmbP21995 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EmbP21995 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EmbP21995 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EmbP21995 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EmbP21995 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EmbP21995 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
EmbP21995 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EmbP21995 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EmbP21995 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EmbP21995 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EmbP21995 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EmbP21995 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms