RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Traf7Q922B6 594 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cxxc1Q9CWW7 660 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Popdc2Q9ES82 367 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Flt4P35917 1363 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vamp4O70480 141 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PdgfrbP05622 1098 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Myd88P22366 296 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Clca2Q8BG22 942 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Skor1Q8BX46 964 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gtpbp3Q923K4 492 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lysmd1Q9D0E3 226 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wnt8bQ9WUD6 350 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm7347D3YYI9 267 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Speer4aF8VPX6 267 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pax4P32115 349 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 NfixP70257 488 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Myoz2Q9JJW5 264 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyp2ab1S4R196 498 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ap1g2O88512 791 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Irf1P15314 329 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Chl1P70232 1209 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 EappQ5BU09 281 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Map3k2Q61083 619 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 HlfQ8BW74 295 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Morc2bQ8C5W4 1022 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif2cQ922S8 721 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MlycdQ99J39 492 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Echdc1Q9D9V3 322 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dpp7Q9ET22 506 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mkrn1Q9QXP6 481 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Oas2E9Q9A9 742 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrrc32G3XA59 663 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pip5k1aP70182 546 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rnf223Q3UV31 285 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ripor2Q80U16 1078 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Angel2Q8K1C0 544 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r199Q8R280 367 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ly6iQ9WU67 134 aa9.72□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa9.71□□□□□ -0.85
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Glt1d1A4FUP9 346 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm4788E9Q8B5 879 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cdk2ap1O35207 114 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 NmiO35309 314 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 EomesO54839 707 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Eif6O55135 245 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Xirp1O70373 1129 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 VdrP48281 422 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tlr7P58681 1050 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rps8P62242 208 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Map9Q3TRR0 646 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mansc4Q3UU94 337 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sytl5Q80T23 753 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dpp9Q8BVG4 862 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Plekhg6Q8R0J1 787 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cables1Q9ESJ1 568 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adarb2Q9JI20 745 aa9.71□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Map3k15A2AQW0 1331 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Myo5bP21271 1818 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 P01647 108 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atp9bP98195 1146 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ksr2Q3UVC0 959 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 BcanQ61361 883 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ddx58Q6Q899 926 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Glis3Q6XP49 780 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ap4e1Q80V94 1122 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sv2bQ8BG39 683 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ivns1abpQ920Q8 642 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ttc14Q9CSP9 761 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam213aQ9CYH2 218 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cwc25Q9DBF7 416 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ehd4Q9EQP2 541 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnq5Q9JK45 933 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gdf11Q9Z1W4 405 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ankrd50F7BE84 1390 aa9.7□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Irgm2A0A140LIF8 407 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Exoc6bA6H5Z3 810 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Impdh2P24547 514 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Best3Q6H1V1 669 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ttc19Q8CC21 365 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ppp4r3bQ922R5 820 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scn11aQ9R053 1765 aa9.69□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm6268A2A3U9 297 aa9.68□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm11758A2BEI6 360 aa9.68□□□□□ -0.86
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm11757A2BEI8 360 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.5 ms