Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
Ldlrad1D3YYZ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Ldlrad1D3YYZ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ldlrad1D3YYZ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Ldlrad1D3YYZ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ldlrad1D3YYZ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ldlrad1D3YYZ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Ldlrad1D3YYZ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Ldlrad1D3YYZ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ldlrad1D3YYZ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ldlrad1D3YYZ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ldlrad1D3YYZ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ldlrad1D3YYZ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ldlrad1D3YYZ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Ldlrad1D3YYZ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ldlrad1D3YYZ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ldlrad1D3YYZ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ldlrad1D3YYZ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Ldlrad1D3YYZ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ldlrad1D3YYZ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Ldlrad1D3YYZ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ldlrad1D3YYZ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ldlrad1D3YYZ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ldlrad1D3YYZ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ldlrad1D3YYZ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ldlrad1D3YYZ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ldlrad1D3YYZ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ldlrad1D3YYZ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ldlrad1D3YYZ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ldlrad1D3YYZ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ldlrad1D3YYZ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ldlrad1D3YYZ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ldlrad1D3YYZ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ldlrad1D3YYZ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ldlrad1D3YYZ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ldlrad1D3YYZ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ldlrad1D3YYZ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Ldlrad1D3YYZ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ldlrad1D3YYZ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ldlrad1D3YYZ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ldlrad1D3YYZ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ldlrad1D3YYZ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ldlrad1D3YYZ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ldlrad1D3YYZ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ldlrad1D3YYZ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ldlrad1D3YYZ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ldlrad1D3YYZ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ldlrad1D3YYZ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ldlrad1D3YYZ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Ldlrad1D3YYZ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ldlrad1D3YYZ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ldlrad1D3YYZ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ldlrad1D3YYZ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Ldlrad1D3YYZ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ldlrad1D3YYZ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ldlrad1D3YYZ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ldlrad1D3YYZ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ldlrad1D3YYZ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ldlrad1D3YYZ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ldlrad1D3YYZ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ldlrad1D3YYZ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ldlrad1D3YYZ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ldlrad1D3YYZ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ldlrad1D3YYZ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ldlrad1D3YYZ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ldlrad1D3YYZ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ldlrad1D3YYZ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ldlrad1D3YYZ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ldlrad1D3YYZ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ldlrad1D3YYZ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ldlrad1D3YYZ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ldlrad1D3YYZ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ldlrad1D3YYZ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ldlrad1D3YYZ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ldlrad1D3YYZ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ldlrad1D3YYZ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ldlrad1D3YYZ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms