RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	PRSS46	E5RG02	174 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	OR10J1	P30954	320 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	RND2	P52198	227 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468		Q8WTZ3	238 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	CELA1	Q9UNI1	258 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH2	Q9P225	4427 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GVY2	172 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	C7orf66	A4D0T2	115 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	CCS	O14618	274 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468		H3BMM0	161 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	BUB3	O43684	328 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	OR1S1	Q8NH92	325 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	DTD1	Q8TEA8	209 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	NRN1	Q9NPD7	142 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	PKHD1	P08F94	4074 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SYNGR2	O43760	224 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	PRAF2	O60831	178 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	TOMM40	O96008	361 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	IL4	P05112	153 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-DRB4	P13762	266 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	NEU1	Q99519	415 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468		U3KQ87	197 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	RD3L	P0DJH9	198 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	IAPP	P10997	89 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	NPY1R	P25929	384 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	NPIPB3	Q92617	1050 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	XCL2	Q9UBD3	114 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468	AGRN	O00468	2067 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MUC1-222	ENST00000610468		P0DMU3	169 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	FAM231A	P0DMU4	169 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	FAM231C	P0DMU5	169 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	H2BFS	P57053	126 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	NOXA1	Q86UR1	476 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		9.96	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	PFDN1	O60925	122 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	SIX6	O95475	246 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	IFNA21	P01568	189 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	PSG1	P11464	419 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	RNF125	Q96EQ8	232 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	ACY3	Q96HD9	319 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM8	Q96KF7	97 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	C2orf50	Q96LR7	162 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM189	A5PLL7	270 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468		H0YIZ8	118 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468		K7EPK0	472 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	WRB	O00258	174 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	RTL8C	O15255	209 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	CCNK	O75909	580 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	ARL16	Q0P5N6	197 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	ALG5	Q9Y673	324 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	SOCS3	O14543	225 aa		9.93	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		9.93	□□□□□ -0.82
MUC1-222	ENST00000610468	MED14OS	P0DP75	135 aa		9.93	□□□□□ -0.82

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