RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 AKR1C3P42330 323 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 SELENOTP62341 195 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF726P1Q15940 193 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 KHDC3LQ587J8 217 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR5T1Q8NG75 326 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR4X1Q8NH49 305 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.93□□□□□ -1.3
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PRKAR1A-211ENST00000586397 M0R143 59 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00869P0C866 280 aa6.93□□□□□ -1.3
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PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC25A22Q9H936 323 aa6.93□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.93□□□□□ -1.3
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PRKAR1A-211ENST00000586397 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.92□□□□□ -1.3
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PRKAR1A-211ENST00000586397 A0A1B0GV50 99 aa6.91□□□□□ -1.3
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PRKAR1A-211ENST00000586397 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.91□□□□□ -1.3
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PRKAR1A-211ENST00000586397 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 PSMB11A5LHX3 300 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM223BA6NKX1 122 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKAR1A-211ENST00000586397 F8W735 103 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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