RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 S4R3C0 116 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAV41A0A0B4J266 112 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 BRI3O95415 125 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 GP9P14770 177 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOSL1P15407 271 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 LY6EQ16553 131 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF125Q96EQ8 232 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZANQ9Y493 2812 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 MT-ND4LP03901 98 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTSGP08311 255 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 RHOGP84095 191 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADIRFQ15847 76 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q8WTZ3 238 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ISOC2Q96AB3 205 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 C15orf32Q32M92 178 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST1H2BAQ96A08 127 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP6V0BQ99437 205 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCEAL7Q9BRU2 100 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFB112Q30KQ8 113 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 S100A7AQ86SG5 101 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 C9JCJ5 164 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 H3BRN7 92 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYCNOSP40205 109 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRTAP1-1Q07627 177 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF212Q495C1 297 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC01551Q86U37 167 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMR3AQ99954 134 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 LY96Q9Y6Y9 160 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD5LO43866 347 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL4P05112 153 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 C2CD4CQ8TF44 421 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF580Q9UK33 172 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLDN34H7C241 214 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOLR2P14207 255 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSPG4Q6UVK1 2322 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIVEP1P15822 2718 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 NBEAP1P0C6P0 100 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 IER3P46695 156 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELOVL1Q9BW60 279 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2T8A6NH00 312 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRYBB3P26998 211 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADMP35318 185 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM24BQ8N5W8 94 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM223BA6NKX1 122 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 H3BUA1 57 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF329Q86UD4 541 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM223AQ8IWN6 122 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5R1Q8NH85 324 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANAPC16Q96DE5 110 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV3-23P01764 117 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C9orf152Q5JTZ5 239 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM190Q8WZ59 177 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRDL1Q9BU40 450 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 LY6G6DO95868 133 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPIFP30405 207 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELOBQ15370 118 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 LEMD1Q68G75 181 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRDM13Q9H4Q3 707 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF24Q9Y225 148 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 HELTA6NFD8 242 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 BLCAPP62952 87 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF414Q96IQ9 312 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC140Q96MF4 163 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV4-59P01825 116 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-210ENST00000574322 YAE1D1Q9NRH1 226 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 AP4M1O00189 453 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 OCC1Q8TAD7 63 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLEC3BP05452 202 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB5AP20339 215 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP5G2Q06055 141 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q6YL49 198 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF98A6NK75 572 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR183P32249 361 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 MS4A10Q96PG2 267 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 F8P00451 2351 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 TLN2Q9Y4G6 2542 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAS2R60P59551 318 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 RANP62826 216 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00527Q9UJ94 153 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGLC2P0DOY2 106 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 S100A7P31151 101 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 BLNKQ8WV28 456 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF586Q9NXT0 402 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa22.06■■□□□ 1.12
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