RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 CCDC32Q9BV29 185 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 PALMDQ9NP74 551 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 ENY2Q9NPA8 101 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 LINC01619G3V211 115 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 OVOL1O14753 267 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 SFT2D2O95562 160 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 IAPPP10997 89 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 CTRB1P17538 263 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 C15orf32Q32M92 178 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 OR5B3Q8NH48 314 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 DCUN1D4Q92564 292 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 IL22RA2Q969J5 263 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 GALNT14Q96FL9 552 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 A0A0B4J2A0 478 aa3.28□□□□□ -1.88
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PTPRK-209ENST00000415046 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 F8WDY8 70 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 SAP30O75446 220 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 CRYGCP07315 174 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 SPNP16150 400 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 SLC6A1P30531 599 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 GPR183P32249 361 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 SYNJ2BPP57105 145 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 DEFA1P59665 94 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-209ENST00000415046 DEFA3P59666 94 aa3.28□□□□□ -1.88
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