RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	GAMT	Q14353	236 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	DCANP1	Q8TF63	244 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	DEDD	O75618	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF688	P0C7X2	276 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIQK	Q629K1	86 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	STH	Q8IWL8	128 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	GLMP	Q8WWB7	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	RARRES2	Q99969	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	BUB3	O43684	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	MED6	O75586	246 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	NDUFB6	O95139	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB11A	P62491	216 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF90	Q03938	601 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	DHRS2	Q13268	280 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	C9orf170	A2RU37	121 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	KNCN	A6PVL3	124 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	WRB	O00258	174 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	SYNGR2	O43760	224 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	RNF125	Q96EQ8	232 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RNPS1-222	ENST00000567147	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	ADAP1	O75689	374 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB40C	Q96S21	281 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	CENPX	A8MT69	81 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	FABP1	P07148	127 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2F1	Q13607	317 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	NRN1	Q9NPD7	142 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		12.76	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	OR4E1	P0C645	316 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	IL7	P13232	177 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	BTC	P35070	178 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	ID3	Q02535	119 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	TRGV9	Q99603	122 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		12.75	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	IFNA21	P01568	189 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	SPP1	P10451	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	LYZ	P61626	148 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	THAP8	Q8NA92	274 aa		12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	PRSS46	E5RG02	174 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147		H3BP45	60 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	DEFB4A	O15263	64 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	12.73	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		12.72	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	PLA2G10	O15496	165 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	C4BPB	P20851	252 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147	FBXL17	Q9UF56	701 aa		12.71	□□□□□ -0.37
RNPS1-222	ENST00000567147		H3BMM0	161 aa		12.7	□□□□□ -0.38
RNPS1-222	ENST00000567147	SSSCA1	O60232	199 aa		12.7	□□□□□ -0.38

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