RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRN3P1Q2M238 152 aa13.65□□□□□ -0.22
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa13.65□□□□□ -0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.65□□□□□ -0.22
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.63□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR11H1Q8NG94 326 aa13.63□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR11H2Q8NH07 326 aa13.63□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV1-16P04430 117 aa13.62□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.62□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.62□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSTCQ9NRP0 149 aa13.62□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.62□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.62□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV1-8P0DP01 117 aa13.61□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD33P20138 364 aa13.61□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ORMDL3Q8N138 153 aa13.61□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.61□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSG1P11464 419 aa13.61□□□□□ -0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.61□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPIPB5A8MRT5 1133 aa13.61□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.61□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0G2JLM5 398 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM50AO95807 157 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXC2Q99958 501 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRD5A1P18405 259 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV40A0A0B4J280 105 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C15orf62A8K5M9 175 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASIPP42127 132 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYPD2Q6UXB3 125 aa13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2CO00762 179 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G2CQ5R387 149 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASCL4Q6XD76 172 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COLCA1Q6ZS62 124 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
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