RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 HELTA6NFD8 242 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 PRSS46E5RG02 174 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF90Q03938 601 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 PYDC2Q56P42 97 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 PSMG4Q5JS54 123 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 NRN1Q9NPD7 142 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A6P12236 298 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 ANXA3P12429 323 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 PPP1R1AQ13522 171 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 OR1S1Q8NH92 325 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 RNF125Q96EQ8 232 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 MFFQ9GZY8 342 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 HRH4Q9H3N8 390 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 FBXL17Q9UF56 701 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 H3BMM0 161 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 SOCS3O14543 225 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 DEDDO75618 318 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 SFT2D2O95562 160 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 IFNA4P05014 189 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 IAPPP10997 89 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 AP3S2P59780 193 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-211ENST00000467464 HLA-DRB4P13762 266 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 MIFP14174 115 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 VAMP1P23763 118 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 DEFB1P60022 68 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PRR20EP86478 221 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PRR20CP86479 221 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PRR20DP86480 221 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PRR20BP86481 221 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PRR20AP86496 221 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 THAP8Q8NA92 274 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C17orf77Q96MU5 243 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 TRGV9Q99603 122 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SRRQ9GZT4 340 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 CELA1Q9UNI1 258 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 HERC2O95714 4834 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZFP92A6NM28 416 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SLC35E1Q96K37 410 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 APLNQ9ULZ1 77 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 HLA-DMBP28068 263 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 LYZP61626 148 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 OR2F1Q13607 317 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 BAK1Q16611 211 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZTC4 211 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 SYNGR2O43760 224 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ADAP1O75689 374 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFB6O95139 128 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 HOXB5P09067 269 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 S100A5P33763 92 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 BTCP35070 178 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF709Q8N972 641 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 XCL2Q9UBD3 114 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 C9orf170A2RU37 121 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC160A6NGH7 325 aa8.6□□□□□ -1.03
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