RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT11	Q96G61	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	APELA	P0DMC3	54 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	BRS3	P32247	399 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	MUC15	Q8N387	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SIAH2	O43255	324 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GPX1	P07203	203 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GP9	P14770	177 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SMIM12	Q96EX1	92 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PGP	A6NDG6	321 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	COX7A1	P24310	79 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CDKN1A	P38936	164 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	RPE	Q96AT9	228 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	RNF5	Q99942	180 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	APCS	P02743	223 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SRI	P30626	198 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2G1	P62253	170 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	MLST8	Q9BVC4	326 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF253	O75346	499 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TSKU	Q8WUA8	353 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ATG101	Q9BSB4	218 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PS18	150 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SLA	Q13239	276 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GPR82	Q96P67	336 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058		I3L2K1	104 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CA7	P43166	264 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PRR27	Q6MZM9	219 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	EREG	O14944	169 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TOMM40	O96008	361 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TDRG1	Q3Y452	100 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PSG1	P11464	419 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FMC1	Q96HJ9	113 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NEU1	Q99519	415 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058		Q9H3A6	140 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LTA	P01374	205 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	LIPF	P07098	398 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058		Q8N976	141 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TOM1-210	ENST00000449058	TCRA	P04437	139 aa		13.45	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms