RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TP53RKQ96S44 253 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HES4Q9HCC6 221 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VSIG4Q9Y279 399 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A0B4J2A0 478 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F5H5P2 479 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AIPO00170 330 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP23AO75900 390 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERPINE1P05121 402 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSG2P11465 335 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPNP16150 400 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF32P17041 273 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXC5Q00444 222 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FCN2Q15485 313 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SSX1Q16384 188 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNPY1Q3B7I2 92 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GLYATQ6IB77 296 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HCP5Q6MZN7 132 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR1L1Q8NH94 360 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEX37Q96LM6 180 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNB4Q9HAV0 340 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GMNCA6NCL1 334 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R2Z0 102 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2A4O95047 310 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LY6G6CO95867 125 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRASP01111 189 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HBZP02008 142 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP5G1P05496 136 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AZU1P20160 251 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBTB25P24278 435 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRIP30626 198 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THBS3P49746 956 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFAP2P55001 183 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BLCAPP62952 87 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSG9Q00887 426 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNIH2Q6PI25 160 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CROCCP2Q86T23 111 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C10orf111Q8N326 155 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MALSU1Q96EH3 234 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2A7Q96R45 310 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 METTL26Q96S19 204 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHST6Q9GZX3 395 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR13Q9H1Z4 485 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CST9LQ9H4G1 147 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CALYQ9NYX4 217 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF7Q9UBF6 113 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PKD1P98161 4303 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1B0GXF2 115 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00862A6NCI5 91 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF850A8MQ14 1090 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC17A2O00624 439 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR7C2O60412 319 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FSTL3O95633 263 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GYPAP02724 150 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BGLAPP02818 100 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HLA-DPB1P04440 258 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FGF6P10767 208 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNTFRP26992 372 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRSS3P35030 304 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 G6PCP35575 357 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCS1P62166 190 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF266Q14584 549 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF181Q2M3W8 571 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAMD12Q8N8I0 201 aa4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms