RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TIGIT	Q495A1	244 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17D	Q8TAD2	202 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		16.07	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A4	P12235	298 aa		16.07	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NPPC	P23582	126 aa		16.07	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NPY1R	P25929	384 aa		16.07	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RND2	P52198	227 aa		16.07	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	16.07	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		16.07	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGB2A1	O75556	95 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB135	Q30KP9	77 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	LRTM2	Q8N967	370 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200		U3KQ87	197 aa		16.06	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRY2	O43597	315 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	PITX3	O75364	302 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	PAFAH1B2	P68402	229 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NOXA1	Q86UR1	476 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	STPG3	Q8N7X2	389 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DTD1	Q8TEA8	209 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF183	Q96D59	192 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL26	Q96S19	204 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SRR	Q9GZT4	340 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	RBKS	Q9H477	322 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200		U3KQE9	123 aa		16.05	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PS18	150 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10J1	P30954	320 aa		16.04	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		16.03	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA10	P01566	189 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPB3	Q92617	1050 aa		16.02	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A6	P12236	298 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RY1	P47900	373 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8WTZ3	238 aa		16.02	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SFT2D2	O95562	160 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	VAMP1	P23763	118 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R1A	Q13522	171 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	BAK1	Q16611	211 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1S1	Q8NH92	325 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CSTL1	Q9H114	145 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		16.01	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	AGRN	O00468	2067 aa		16	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0J9YWU9	116 aa		16	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EQG2	157 aa		16	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	LYG2	Q86SG7	212 aa		16	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ACY3	Q96HD9	319 aa		16	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TOMM40	O96008	361 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB131A	P59861	70 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DCANP1	Q8TF63	244 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	GLMP	Q8WWB7	406 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RABAC1	Q9UI14	185 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		15.99	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	MPTX1	A8MV57	137 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	LEMD1	Q68G75	181 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		15.98	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA4	P05014	189 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	IL4	P05112	153 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	15.97	■□□□□ 0.15	2e-6	■■■■□ 20.4
PPP4C-205	ENST00000563200	RD3L	P0DJH9	198 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	GAMT	Q14353	236 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		15.97	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFB6	O95139	128 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG1	P11464	419 aa		15.96	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
PPP4C-205	ENST00000563200	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		15.95	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	BUB3	O43684	328 aa		15.95	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		15.95	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HELT	A6NFD8	242 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIQK	Q629K1	86 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf170	A2RU37	121 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NHS1	94 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXB5	P09067	269 aa		15.94	■□□□□ 0.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.6 ms