RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
LRP1-204ENST00000553277 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.96□□□□□ -0.01
LRP1-204ENST00000553277 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.96□□□□□ -0.01
LRP1-204ENST00000553277 Q96MF0 132 aa14.96□□□□□ -0.01
LRP1-204ENST00000553277 TBX15Q96SF7 602 aa14.96□□□□□ -0.01
LRP1-204ENST00000553277 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.96□□□□□ -0.01
LRP1-204ENST00000553277 NOTCH2Q04721 2471 aa14.96□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 LY6LH3BQJ8 138 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 IGLV2-23P01705 113 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 DLX1P56177 255 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 SFRP2Q96HF1 295 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 ZANQ9Y493 2812 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 RNF223E7ERA6 249 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 TOX4O94842 621 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 FAM78BQ5VT40 261 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OR10J1P30954 320 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 NECAP1Q8NC96 275 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 DERL1Q9BUN8 251 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 A0A1W2PPQ1 181 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 UBE2E1P51965 193 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 TEX45Q8NA69 505 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 ABCA1O95477 2261 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 A0A1W2PRE2 83 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 COX7A1P24310 79 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 SELENOTP62341 195 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 PYY3Q5JQD4 70 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 TEX38Q6PEX7 206 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 THAP8Q8NA92 274 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 ZNF114Q8NC26 417 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 DPM3Q9P2X0 92 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 PSMB11A5LHX3 300 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 C8orf88P0DMB2 117 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 HTR1DP28221 377 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OR1P1Q8NH06 330 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OCC1Q8TAD7 63 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 CGB1A6NKQ9 187 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 J3QLI3 93 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OR10J4P0C629 311 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 REG1BP48304 166 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 WT1-ASQ06250 92 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 KLRD1Q13241 179 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 PSG5Q15238 335 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 PFDN5Q99471 154 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP1-204ENST00000553277 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.89□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 OOSP1A8MZH6 123 aa14.89□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 MMD2Q8IY49 270 aa14.89□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 ZNF503Q96F45 646 aa14.89□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.89□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 CRYGBP07316 175 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 CEACAM3P40198 252 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 MOB3BQ86TA1 216 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 AJUBAQ96IF1 538 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP1-204ENST00000553277 RNF5Q99942 180 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.4 ms