RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 OR1S2Q8NGQ3 325 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 MUC7Q8TAX7 377 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 FAM110AQ9BQ89 295 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 FAM90A26D6RGX4 464 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 SCGB2A1O75556 95 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 HOXB5P09067 269 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 OR10J1P30954 320 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 GGNBP1Q5YKI7 109 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 ETFRF1Q6IPR1 90 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 TCF24Q7RTU0 167 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 C3orf84H3BNL1 204 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 PLA2G10O15496 165 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 CRYBB3P26998 211 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 BMI1P35226 326 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 DHRS2Q13268 280 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 NPIPB3Q92617 1050 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 ACY3Q96HD9 319 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 CENPXA8MT69 81 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 ADAP1O75689 374 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 OR4E1P0C645 316 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 IAPPP10997 89 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 NPPCP23582 126 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 TFPI2P48307 235 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 LYG2Q86SG7 212 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 METTL26Q96S19 204 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-219ENST00000550655 CSMD3Q7Z407 3707 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 DFFBO76075 338 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 CD5P06127 495 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 GBGT1Q8N5D6 347 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 TMEM231Q9H6L2 316 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 U3KQE9 123 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 MPTX1A8MV57 137 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 IFNA4P05014 189 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 ZNF124Q15973 351 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 MAGT1Q9H0U3 335 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 A0A1W2PS18 150 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 LYRM1O43325 122 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 SYNGR2O43760 224 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 MED6O75586 246 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 TOMM40O96008 361 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 P2RY1P47900 373 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 GAMTQ14353 236 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 CASC10Q5T4H9 136 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 COQ8AQ8NI60 647 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 Q8WTZ3 238 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 C20orf85Q9H1P6 137 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 A6NHS1 94 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 PRSS46E5RG02 174 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 IL4P05112 153 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 PAFAH1B2P68402 229 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 CNPY1Q3B7I2 92 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 C4orf46Q504U0 113 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 SLC35E1Q96K37 410 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 CCDC32Q9BV29 185 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 WRBO00258 174 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 PSG1P11464 419 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 APOC4P55056 127 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 RAB11AP62491 216 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 OR4D5Q8NGN0 318 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 GLMPQ8WWB7 406 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 K7EQG2 157 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 RD3LP0DJH9 198 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 LYL1P12980 280 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 ID3Q02535 119 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 C16orf54Q6UWD8 224 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 KIR2DL5AQ8N109 375 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 MITD1Q8WV92 249 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-219ENST00000550655 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-219ENST00000550655 H3BP45 60 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-219ENST00000550655 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-219ENST00000550655 TCRBP04435 133 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-219ENST00000550655 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms