RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 Q0VG73 95 aa13.53□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 MYO18BQ8IUG5 2567 aa13.53□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.53□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 A0A1W2PS18 150 aa13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 ZNF253O75346 499 aa13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 STAG3L2P0CL84 134 aa13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 STAG3L3P0CL85 134 aa13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 LCN12Q6JVE5 192 aa13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 FAM222BQ8WU58 562 aa13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 PLEKHA3Q9HB20 300 aa13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PFKL-211ENST00000498841 SHISA9B4DS77 424 aa13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 LY6DQ14210 128 aa13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 LEMD1Q68G75 181 aa13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 RAB1CQ92928 201 aa13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 RITA1Q96K30 269 aa13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 VPS25Q9BRG1 176 aa13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.52□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CXorf1O96002 111 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 C3orf79P0CE67 100 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 RBPJQ06330 500 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 RTL8BQ17RB0 113 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 FLNCQ14315 2725 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 SRIP30626 198 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 NUP37Q8NFH4 326 aa13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 SLC25A17O43808 307 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 AARDQ4LEZ3 155 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 LRRC10Q5BKY1 277 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 OR10J4P0C629 311 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 OR9G1Q8NH87 305 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 KCNS1Q96KK3 526 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 V9GYV3 84 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CD3EP07766 207 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CD24P25063 80 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 GCHFRP30047 84 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 STPG3Q8N7X2 389 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 OR4P4Q8NGL7 312 aa13.5□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 FAM208BQ5VWN6 2430 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 HCP5Q6MZN7 132 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 COMMD5Q9GZQ3 224 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.49□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CNTFRP26992 372 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TP73-AS1Q9UF72 201 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 OPRK1P41145 380 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CENPWQ5EE01 88 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 PRR31Q5SQ13 230 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 NIT1Q86X76 327 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.254e-7■■■□□ 15.6
PFKL-211ENST00000498841 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 APOA2P02652 100 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 MIR17HGQ75NE6 70 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 C1orf159Q96HA4 380 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.48□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CFAP46Q8IYW2 2715 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 VSTM5A8MXK1 200 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CRYBB3P26998 211 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 LOXP28300 417 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 CR1LQ2VPA4 569 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TSPOP30536 169 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 GNG4P50150 75 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TEX36Q5VZQ5 186 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 MUC15Q8N387 334 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 VPS13CQ709C8 3753 aa13.47□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 OR7C2O60412 319 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 EFNB3Q15768 340 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TEPPQ6URK8 271 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 NGBQ9NPG2 151 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 BMPR1BO00238 502 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 BORCS7Q96B45 105 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 POLQO75417 2590 aa13.46□□□□□ -0.25
PFKL-211ENST00000498841 LOC105371242A0A075B767 164 aa13.46□□□□□ -0.26
PFKL-211ENST00000498841 PRRX1P54821 245 aa13.46□□□□□ -0.26
PFKL-211ENST00000498841 UBE2V1Q13404 147 aa13.46□□□□□ -0.26
PFKL-211ENST00000498841 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms