RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KALRNO60229 2985 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FCN3O75636 299 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV2-23P01705 113 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 GAB2Q9UQC2 676 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CBY3A6NI87 242 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TGOLN2O43493 480 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGHG2P01859 326 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ORM1P02763 201 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RAB4BP61018 213 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOTP62341 195 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RANP62826 216 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TEPPQ6URK8 271 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 U3KQK5 164 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0B4J2A0 478 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ARPC5O15511 151 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 PRAF2O60831 178 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CD74P04233 296 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2G2P60604 165 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LCN15Q6UWW0 184 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CADM3Q8N126 398 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N9W7 124 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 P2RY1P47900 373 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 B2MP61769 119 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 PFDN5Q99471 154 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF546Q86UE3 836 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR11H2Q8NH07 326 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF735P0CB33 412 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TCF23Q7RTU1 214 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LYG2Q86SG7 212 aa3.49□□□□□ -1.85
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