RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ACSS3-208	ENST00000616449	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ACSS3-208	ENST00000616449	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ACSS3-208	ENST00000616449	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ACSS3-208	ENST00000616449	NEU1	Q99519	415 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ACSS3-208	ENST00000616449	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ACSS3-208	ENST00000616449	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	VENTX	O95231	258 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRY4	Q9C004	299 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	UPK2	O00526	184 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	GZMB	P10144	247 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	DLL1	O00548	723 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PNKD	Q8N490	385 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	CCL21	O00585	134 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449		P01737	135 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHG3	P01860	377 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	BRS3	P32247	399 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	C14orf144	Q96I85	54 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	IL36B	Q9NZH7	164 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	HTR1D	P28221	377 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449		A6NNC1	897 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	HYPM	O75409	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	WNT2	P09544	360 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	LMO1	P25800	156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TFPI2	P48307	235 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449		Q8TCH9	128 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PIEZO1	Q92508	2521 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PROP1	O75360	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	GCG	P01275	180 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	CTAG1A	P78358	180 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF2	Q99496	336 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449		F2Z2F3	143 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PRRX1	P54821	245 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449		M0QZ24	198 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	GNG7	O60262	68 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	SORL1	Q92673	2214 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	MUC15	Q8N387	334 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PERP	Q96FX8	193 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	DKK4	Q9UBT3	224 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ACSS3-208	ENST00000616449	NUPR1	O60356	82 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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