RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMC5P62195 406 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 KHDC3LQ587J8 217 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZS49 121 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR7G1Q8NGA0 311 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR52E4Q8NGH9 312 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR13D1Q8NGV5 346 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10AG1Q8NH19 301 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 NT5C3BQ969T7 300 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYTH2Q99418 400 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPER1Q99527 375 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB1BQ9H0U4 201 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 DMAC2Q9NW81 257 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R3Q9NYW6 316 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC2DQ9UHP7 191 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSC2P49815 1807 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 KNL1Q8NG31 2342 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXCL8P10145 99 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPRR1BP22528 89 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB13P51153 203 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLKP1Q107X0 134 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANGPT1Q15389 498 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCN8Q6JVE9 175 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4K17Q8NGC6 315 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 ISOC1Q96CN7 298 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM56Q96MV1 263 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL36BQ9NZH7 164 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCTPQ9UKL6 214 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX6Q9UNH7 406 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 F2Z2F3 143 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-30P01768 117 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUPD1Q68J44 220 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 PQLC3Q8N755 202 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO32Q969P5 355 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL13Q99616 98 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R13Q9NYV9 303 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCC9O60706 1549 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 INSRP06213 1382 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 PQLC2LA1A4F0 135 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 B4DSR2 109 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 E7EUB6 86 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMOX2P30519 316 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2Y1Q8NGV0 311 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2T35Q8NGX2 323 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 HYPKQ9NX55 129 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 EYSQ5T1H1 3165 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0G2JMM0 328 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PPB8 328 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERC2-IT1O76042 136 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAD51Q06609 339 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJC3Q13217 504 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBE2J2Q8N2K1 259 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR52L1Q8NGH7 329 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEX2Q9BXY8 128 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANAPC10Q9UM13 185 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPRASP1Q5JY77 1395 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIOO75962 3097 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX46H3BTG2 121 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 K7EN84 100 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYTH3O43739 400 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-33P01772 117 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRM2P04554 102 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRMS1LQ5PSV4 323 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOK4Q8TEW6 326 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSDMAQ96QA5 445 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 GINS4Q9BRT9 223 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERP44Q9BS26 406 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 COPS4Q9BT78 406 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRYQ5TBA9 3013 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-871P-201ENST00000516122 LST1O00453 97 aa-3.89□□□□□ -3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 204.9 ms