RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TXN2	Q99757	166 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RBKS	Q9H477	322 aa		13.09	□□□□□ -0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	WRB	O00258	174 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424		S4R3C0	116 aa		13.08	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	PITX3	O75364	302 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAP1	O75689	374 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2C1	O95371	312 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	MT-CO2	P00403	227 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	NPY1R	P25929	384 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	NPBWR1	P48145	328 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	MFAP2	P55001	183 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB11A	P62491	216 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.07	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP5D1	E7EU14	171 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EIM0	57 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	GNG7	O60262	68 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	FOLR2	P14207	255 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	CBLN1	P23435	193 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR183	P32249	361 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	OPRK1	P41145	380 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF785	A8K8V0	405 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424		I3L2K1	104 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	TGOLN2	O43493	480 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNGR2	O43760	224 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA4	P05014	189 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.05	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	PTTG1	O95997	202 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A4	P12235	298 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC7	Q8TAX7	377 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.04	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.03	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		13.03	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.03	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.02	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.02	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.02	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	IAPP	P10997	89 aa		13.02	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	ID3	Q02535	119 aa		13.02	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	HAGH	Q16775	308 aa		13.02	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.02	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EMT4	169 aa		13.01	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.01	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.01	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.01	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.01	□□□□□ -0.33
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.01	□□□□□ -0.33

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