RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 GUCA2BQ16661 112 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 AKAP14Q86UN6 197 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 NECAP1Q8NC96 275 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR4A16Q8NH70 328 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR1S1Q8NH92 325 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CCDC140Q96MF4 163 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 NMES1Q9C002 83 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 PRNDQ9UKY0 176 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 ST8SIA3O43173 380 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 NXPH3O95157 252 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 FGF2P09038 288 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 FOLR2P14207 255 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 ID3Q02535 119 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 ASB13Q8WXK3 278 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CGB1A6NKQ9 187 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR11H12B2RN74 326 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 G3V3Q6 166 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 SCGB1D2O95969 90 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF9Q07011 255 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 RAB32Q13637 225 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 Q5BKY6 102 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 H0YIZ8 118 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 SMLR1H3BR10 107 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 K7EPK0 472 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 PSMB6P28072 239 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 MAS1LP35410 378 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 ARL3P36405 182 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 S100A10P60903 97 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 SPCS3P61009 180 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 SPINK9Q5DT21 86 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR52E5Q8NH55 327 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 RBKSQ9H477 322 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 MLXQ9UH92 298 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 ZNF320A2RRD8 509 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 TMEM213A2RRL7 107 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 LGALS9O00182 355 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 MPC2O95563 127 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 IFNA17P01571 189 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CRYGCP07315 174 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CTRB1P17538 263 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CBLN1P23435 193 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 OR5B3Q8NH48 314 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 RNF126Q9BV68 326 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-212ENST00000485532 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SYNGR2O43760 224 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SSSCA1O60232 199 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PFDN1O60925 122 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TMEM50AO95807 157 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 PRCDQ00LT1 54 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TM4SF20Q53R12 229 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 GPHB5Q86YW7 130 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 HINT2Q9BX68 163 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 MBD2Q9UBB5 411 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-212ENST00000485532 WRBO00258 174 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms