RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 MST1LQ2TV78 715 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.54■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 TIAF1O95411 115 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXL15Q9H469 300 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 GAGE12BA1L429 117 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A087X0K7 114 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 hDV102S1A0JD36 115 aa15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 UPK2O00526 184 aa15.52■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP5G2Q06055 141 aa15.52■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 PSMB11A5LHX3 300 aa15.52■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.52■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 TREML4Q6UXN2 200 aa15.52■□□□□ 0.08
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKCP01834 107 aa15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 GAGE2BQ13066 116 aa15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 GAGE2EQ4V326 116 aa15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 GAGE2DQ9UEU5 116 aa15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 ESDP10768 282 aa15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 PSG7Q13046 419 aa15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 LYL1P12980 280 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 NMSQ5H8A3 153 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 NUP37Q8NFH4 326 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 CEACAM4O75871 244 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 PPBPP02775 128 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 Q6ZT83 130 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM106AQ4KMX7 169 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 FREM3P0C091 2139 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TM4SF5O14894 197 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV1D-12P01611 117 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV4-39P01824 125 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 OR9G9P0C7N8 305 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM201AQ5SY85 155 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.51■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 FABP5P3A8MUU1 101 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 GUSBP1Q15486 140 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 COX11Q9Y6N1 276 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM216BQ8N7L0 139 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 JMJD8Q96S16 334 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TIMP4Q99727 224 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A2Q9BXI2 301 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV3-23P01764 117 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 CD69Q07108 199 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 C21orf62Q9NYP8 219 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 MPDZO75970 2070 aa15.5■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 BMPERQ8N8U9 685 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 PSG8Q9UQ74 426 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 YPEL1O60688 119 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 YPEL2Q96QA6 119 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF815PA8K554 130 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 H7C1H1 209 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.49■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 GLRXP35754 106 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 RRN3P1Q2M238 152 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 CECR9P0C854 216 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 RASL11AQ6T310 242 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 LCTP09848 1927 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 NPFFO15130 113 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV3-20P01619 116 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.48■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCA1O95477 2261 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 CD5LO43866 347 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 DUTP33316 252 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 FGF11Q92914 225 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 CELA3AP09093 270 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 MORN2Q502X0 79 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 TRAV5A0A0B4J249 113 aa15.46■□□□□ 0.07
AMIGO1-202ENST00000369864 PAX2Q02962 417 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms